Kas ir pirimidīns?

Pirimidīns ir molekulu grupa, kas ir daļa no DNS un RNS struktūras. Šīm molekulām ir viena gredzena struktūra, kas sastāv no sešiem atomiem. Ir vairākas pirimidīna molekulas, bet tikai citozīns un timīns ir daļa no DNS struktūras, savukārt citozīns un uracils ir daļa no RNS struktūras. Šīs molekulas saistās ar saviem purīna līdziniekiem, lai savienotu divas DNS vai RNS polimēra virknes. Pirimidīnam līdzīgas zāles ir lietotas noteiktu stāvokļu, tostarp ādas vēža un keratozes, ārstēšanai.

Citozīnam, timīnam un uracilam ir sešu locekļu gredzena struktūra. Uracilam gredzenam ir pievienoti divi skābekļa atomi. Citozīnam gredzenam ir pievienots viens skābekļa atoms un viena amīna grupa (-NH2), savukārt timīnam ir divi skābekļa atomi un metilgrupa (-CH3). Katras šīs pirimidīna molekulas gredzena struktūra satur divus slāpekļa atomus un četrus oglekļa atomus.

Pirimidīni saistās ar purīniem, lai savienotu divas DNS vai RNS polimēra virknes. Adenīns un guanīns ir purīni, un katram no tiem ir pieclocekļu un sešu locekļu gredzens, kas ir savienoti kopā. DNS citozīns saistās ar guanīnu, bet timīns – ar adenīnu. Savienojumu starp citozīnu un guanīnu veido trīs ūdeņraža saites, savukārt savienojumu starp timīnu un adenīnu veido divas ūdeņraža saites. RNS uracils ieņem timīna vietu un saistās ar adenīnu.

Ja cukura grupa ir saistīta ar pirimidīnu vai purīnu, to sauc par nukleozīdu. Deoksicitozīns un (deoksi)timidīns ir pirimidīna nukleozīdi, un deoksiadenozīns un deoksiguanozīns ir purīna nukleozīdi. DNS cukurs ir dezoksiriboze, kas ir piecu ogļu cukura molekula, kurai trūkst hidroksilgrupas (-OH), kas parasti atrodas ribozes cukura molekulā. Ar RNS cukura molekula ir riboze, un nukleozīdus parasti nosauc bez prefiksa “deoksi”.

Pilnīgs nukleotīds sastāv no slāpekļa bāzes, kas ir pirimidīns vai purīns, cukura molekulas un fosfātu grupas. Fosfātu grupa saistās ar nukleozīda cukura molekulu, izmantojot estera savienojumu. Viens nukleotīds ir saistīts ar citu nukleotīdu ar fosfodiestera saiti.

Fluurouracils ir zāles, kas pēc struktūras ir līdzīgas pirimidīna uracilam. To parasti lieto, lai ārstētu noteikta veida ādas vēzi, ko sauc par virspusējo bazālo šūnu karcinomu, un citām ādas slimībām, tostarp zvīņainiem vai garozas bojājumiem, ko izraisa pārmērīga saules iedarbība. Zāles parasti pārdod krēma veidā.