Arheoloģijas programmatūra ir viens no plašajiem rīkiem, ko arheologi izmanto, lai izprastu cilvēces kultūras vēsturi un aizvēsturi. Arheologi izmanto īpašu programmatūru, lai uzzīmētu arheoloģisko vietu atrašanās vietas, kalibrētu radiooglekļa datumus un sekotu līdzi artefaktu attiecībām. Arheoloģijas programmatūra arheologam var būt tikpat svarīgs rīks kā špakteļlāpstiņa vai ota.
Ģeogrāfiskās informācijas sistēmas (GIS) ir viens no svarīgākajiem arheoloģijas programmatūras veidiem. ĢIS programma saglabā datus par vietu atrašanās vietu, artefaktiem un reljefa iezīmēm, ļaujot arheologam ģenerēt kartes, kas vizuāli parāda to savstarpējās attiecības. ĢIS programmatūra var palīdzēt arī ar cita veida analīzi, piemēram, skata analīzi, kurā arheologs pārbauda redzamības līnijas, kas savieno dažādus ainavas punktus.
ĢIS programmas nav tikai arheoloģijas programmatūras veids. Daudzas citas profesijas izmanto šāda veida programmatūru. Neskatoties uz to, ĢIS programmām ir tik liela nozīme mūsdienu arheoloģijā, ka tās jāuzskata par galveno arheologu instrumentu.
Radiooglekļa datēšana ir svarīga metode, ar kuras palīdzību arheologi nosaka organisko atlieku, piemēram, koka, kaulu, ādas vai citu augu vai dzīvnieku audu vecumu, vecumu. Izmērot radioaktīvā oglekļa-14 daudzumu objektā un salīdzinot to ar šī izotopa zināmo sabrukšanas ātrumu, tiek iegūts objekta vecuma novērtējums. Šis neapstrādātais aprēķins ir jākalibrē, lai vienumam izveidotu iespējamo kalendāra datumu diapazonu. Lai kalibrētu datumus, arheologi izmanto jebkuru no daudzām arheoloģijas programmatūras daļām, kas paredzētas datumu kalibrēšanai. Daudzi no tiem, piemēram, OxCal, ko ražo Oxford Radiocarbon Accelerator Unit, var arī veikt papildu statistisko analīzi par datēšanas pierādījumiem, lai sašaurinātu datumu diapazonu.
Pētot vietu, arheologi pēta arī tās stratigrāfiju, izrakto objektu telpiskās attiecības. Zinot, kuri objekti atrodas virs vai zem viens otra vietnes slāņos vai slāņos, arheologi palīdz noteikt hronoloģiju vai laika grafiku. Stratigrāfiskās attiecības starp objektiem dažkārt var būt sarežģītas. Šādos gadījumos stratigrāfiskais plāns palīdz noskaidrot attiecības. Lai izveidotu šīs diagrammas, pastāv vairākas programmatūras pakotnes.
Pastāv dažādas specializētas programmatūras pakotnes arheologiem. Tomēr daudzas no svarīgākajām arheoloģijas programmatūras daļām vispār nav specifiskas šai jomai. Statistikas pakotnes, datu bāzu programmas un cita izplatīta programmatūra ir svarīga mūsdienu arheoloģijas sastāvdaļa.