Termins digitālais mikroskops var apzīmēt divus dažādus iestatījumus. Tas var būt vai nu optiskais mikroskops ar pievienotu videokameru vai digitālo kameru, vai mikroskops ar integrētu kameru. Jebkurā gadījumā tas spēj izvadīt skatu uz skatuves kā digitālo attēlu, un jebkurā gadījumā kameru var saukt par digitālā mikroskopa kameru. Digitālā mikroskopa kamerai, kas pievienota optiskajam mikroskopam, ir tāds trūkums, ka objektīvi ir paredzēti cilvēka acij, nevis kamerai, tāpēc attēla kvalitāte var būt zemāka par to, kas iegūta ar integrētu modeli. No otras puses, dažiem integrētajiem modeļiem nav okulāra un tie ir atkarīgi no monitora palielināšanas.
Digitālā mikroskopa kamera nodrošina vairākas iespējas, kas nav pieejamas mikroskopā, kuram nav šādas kameras. Tas ļauj saglabāt attēlus uzskaitei, pārsūtīt internetā vai iekļaut dokumentos. Projicēts attēls ļauj veikt pētījumus prom no mikroskopa un koplietot attēlu ar citiem, piemēram, studentu vai kolēģu grupu, un palielinājums var arī uzlabot datu izpratni. Ar videokameru tiek pievienota iespēja ierakstīt un koplietot skatījumu uz kādu parādību vai eksperimentu laika gaitā.
Ir monokulāri optiskie mikroskopi un trinokulārie mikroskopi, kas ir paredzēti, lai atvieglotu digitālā mikroskopa kameras vai videokameras pievienošanu. Monokulārā mikroskopa gadījumā digitālā kamera ir piemērota vienam okulāram. Ar trinokulāro mikroskopu kamera tiek piestiprināta pie trešā okulāra, kas ir īpaši paredzēts šim lietojumam. Pievienojot mikroskopam digitālā mikroskopa kameru, parastais savienotājs ir C-mount mikroskopa adapteris.
Pirmo digitālo mikroskopu uzbūvēja Hirox® 1986. gadā. USB un FireWire tagad nodrošina tiešu savienojumu starp digitālā mikroskopa kameru un datoru. Citas svarīgas atšķirības digitālā mikroskopa uzstādījumos ir optikas kvalitāte, okulāra pieejamība, kameras megapikseļu skaits, izmantotā attēla programmatūra, tas, vai mikroskops atrodas uz statīva vai rokas, un izmaksas. .