Ir daži dabiski veidi, kā atbrīvoties no mājas mušu, taču dažos gadījumos šīs metodes var aizņemt ilgāku laiku, lai sasniegtu rezultātus, salīdzinot ar pesticīdu lietošanu. Viena izplatīta metode ietver piekārtas līmlentes izmantošanu. Mušas pievelk viss salds, tāpēc tās parasti var notvert, ēdot šķidrumus vai ēdienus ar saldinātājiem, piemēram, medu, želeju vai sīrupu.
Mušu līmlente nav pievilcīga, ja tā tiek izkārta visā mājā, taču parasti tas ir diezgan efektīvs veids, kā atbrīvoties no mājas mušu. Parasti mušu lente ir izgatavota no garām vaska materiāla sloksnēm, kas ir stipri pārklātas ar biezu, saldinātu līmi. Šīs sloksnes ir piestiprinātas pie griestiem, izmantojot īkšķus. Kad mājas mušas saskaras ar mušu lenti, tās iesprūst un drīz mirs. Parasti katrā telpā ir jāpakar vismaz viena sloksne un jāmaina sloksnes, tiklīdz tās ir stipri inficētas.
Mušu lenti var iegādāties lielākajā daļā pārtikas preču un datortehnikas veikalu pesticīdu sadaļā, taču daži cilvēki izvēlas to izgatavot paši. To var izdarīt, sagriežot vaska papīru vai audumu garās šaurās sloksnēs. Pēc tam sloksnes vajadzētu iemērkt medū vai melase. Kad sloksnes ir stipri pārklātas, tās jāpiekar pie griestiem. Vairumā gadījumu šīs paštaisītās sloksnes noķers mušas tikpat labi kā veikalā nopērkamā šķirne.
Vēl viena populāra dabiska metode, kas paredzēta mājas mušu atbrīvošanai, ir saldināta ūdens vai kolas lietošana. Krūzes, kas ir piepildītas ar šķidrumu, jānovieto ap māju vietās, kas ir mušu inficētas. Galu galā mušas piesaistīs šķidrums krūzēs. Parasti, nonākušas krūzēs, mušas nespēj izkļūt ārā. Šī metode prasa biežu ar mušu pildītu krūzīšu iztukšošanu un uzpildīšanu, lai novērstu antisanitāru apstākļu rašanos.
Veneras mušu slazdi ir telpaugi, kas ēd kukaiņus, un vairāki no šiem augiem pie logiem un durvīm var palīdzēt samazināt mušu populāciju. Papildus tam, ka šie augi ir efektīvs, dabisks veids, kā atbrīvoties no mājas mušu, tie parasti lieliski papildina lielāko daļu telpu. Veneras mušu slazdus ir diezgan viegli kopt, un tiem vajadzētu būt efektīviem mušu atbaidīšanas līdzekļiem visos gadalaikos. Lielākajā daļā stādaudzētavu un siltumnīcu ir Veneras mušu slazdi, un augi parasti nav dārgi, ja tos iegādājas kā stādus. Lielāki, pilngadīgi augi var maksāt nedaudz vairāk.