Labam pundurkociņu mēslojumam nav jābūt īpašam koku mēslojumam, un tajā var izmantot to pašu augu barību kā citiem augiem. Labākais mēslojums pundurkociņu kokiem tomēr ir jāsabalansē starp trim galvenajām barības vielām. Turklāt nevajadzētu izmantot pārāk bagātīgu pundurkociņu mēslojumu. Lapu mēslojums, kas ir šķidrs dārza mēslojums, kas izsmidzināts uz lapotnes, un šķīstošais augsnes mēslojums ir vislabākais augšanas sezonā. Mūžzaļajiem augiem ziemā vislabāk ir izmantot lēnas iedarbības granulas.
Visiem kokiem un augiem, tostarp pundurkociņiem, ir nepieciešamas vienas un tās pašas barības vielas: slāpeklis, fosfāti un potašs. Slāpeklis veicina spēcīgus stublājus un veselīgas lapas. Fosfāti baro un stiprina saknes. Potašs veicina izturību pret sēnīšu slimībām un nodrošina augu izturību pret skarbajiem klimatiskajiem apstākļiem. Visas etiķetes uz augu pārtikas vai mēslošanas līdzekļiem norāda uz šīm trim barības vielām šādā secībā: slāpeklis (N), tad kālijs (P), tad potašs (K).
Bonsai kokiem ir vajadzīgas šīs pašas trīs barības vielas, kā arī sīkie mikroelementi, piemēram, molibdēns, magnijs, cinks un bors. Lielākajai daļai mēslošanas līdzekļu ir šie mikroelementi, kā arī trīs galvenie elementi. Vispārējai lietošanai paredzētā pundurkociņu mēslojumā ir jāsabalansē trīs galvenie elementi. Taču rudenī platlapju sugām vajadzētu izmantot mēslojumu bez slāpekļa, lai dzinumi pirms ziemas varētu sacietēt. No otras puses, mūžzaļajiem kokiem ziemai ir nepieciešams zemas izturības, lēnas iedarbības mēslojums, jo aukstajos mēnešos tie paliek nedaudz aktīvi.
Mēslošanas līdzekļu etiķetēs būs burti “NPK”, kas norāda uz trim galvenajām barības vielām, kam seko trīs cipari, kas norāda katras no trim barības vielām svara procentus. Labākajam pundurkociņu mēslojumam būs NPK vērtējums “7:8:8”. Tas ir visu uzturvielu līdzsvars, un tas nebūs pārāk spēcīgs vai pārāk bagāts. Augstāks NPK vērtējums, piemēram, “20:15:15”, ir pārāk bagāts un izraisīs pundurkociņa sakņu apdegumu. Neizmantojiet telpaugu mēslojumu, jo gandrīz visi tie ir pārāk bagāti.
Bonsai kokam ir nepieciešams mēslojums ar pusi no mēslošanas līdzekļa vai augu pārtikas etiķetē norādītā stipruma. No otras puses, mēslošana jāveic divreiz biežāk, kā norādīts uz etiķetes. Nepārbarojiet pundurkociņu. Nebarojiet pundurkociņu koku ziemas mēnešos. Ievērojot šos vienkāršos pundurkociņu mēslojuma lietošanas noteikumus, tiks iegūts labi barots pundurkociņš.