Termini “seminārs” un “bībeles koledža” bieži tiek lietoti kā sinonīmi, taču, lai gan termini ir saistīti, tie parasti nav sinonīmi. Gan Bībeles koledža, gan seminārs ir augstākās izglītības iestādes, un abas koncentrējas uz kādu Svēto Rakstu studiju aspektu; abas var piešķirt arī grādus teoloģijā vai reliģiskās mācības elementos. Tas ir iestāžu galvenais mērķis, kur ir atšķirība. Lielāko daļu laika Bībeles koledžas ir bakalaura iestādes, kas koncentrējas uz Svētajiem Rakstiem un piedāvā grādus par reliģiskām tēmām, bet parasti piedāvā arī galvenos grādus mākslā un zinātnē. No otras puses, semināri parasti ir augstskolas, kuru mērķis ir sagatavot studentus kļūt par reliģiskiem vadītājiem.
Studenti parasti izvēlas apmeklēt Bībeles koledžu un semināru dažādu iemeslu dēļ. Bībeles koledžas parasti tiek apzīmētas kā parastās koledžas, tikai ar Bībeles noslieci. Studenti no kristiešu izcelsmes, kuri vēlas koledžas pilsētiņas kopienu, kas audzinātu viņu uzskatus, bieži izvēlas apmeklēt Bībeles koledžas. Seminārs ir paredzēts studentiem, kuri vēlas veidot karjeru kalpošanā.
Lielākajai daļai Bībeles koledžu ir nepieciešams noteikts kredītstundu skaits Bībeles studijās vai citās reliģijas stundās, taču bieži vien tās piedāvā grāda programmas, kas ir salīdzināmas ar laicīgajām skolām. Studentiem, kuri absolvējuši Bībeles koledžas, būs stingrs pamats Bībeles teoloģijā, taču viņi var veikt dažādus karjeras ceļus. Bībeles koledžas parasti neapmāca studentus kādam noteiktam aicinājumam, bet drīzāk cenšas nodrošināt plašu, bet uz Bībeli vērstu koledžas izglītību. Bībeles koledžas grāds var būt dažādās disciplīnās. Šajā ziņā Bībeles koledža un seminārs galvenokārt atšķiras.
Semināra galvenais mērķis ir izglītot topošos draudžu vadītājus. Lielākā daļa semināru ir absolventu līmeņa iestādes, kas nozīmē, ka tās piedāvā tikai maģistra un doktora grādus. Pirms semināra apmeklēšanas parasti ir nepieciešams bakalaura grāds. Dažos semināros pretendentiem ir jāiegūst iepriekšējs grāds reliģijā vai teoloģijā, kā to varētu iegūt Bībeles koledžā, taču ne visi to dara.
Semināru studenti savā seminārā apmeklē kursus, kas ir pielāgoti, lai sagatavotu viņus noteiktam darbam draudzē. Diakoniem, priesteriem un mācītājiem parasti ir jābūt semināra absolventiem, pirms viņus var iecelt par baznīcu vadītāju. Daudziem sludinātājiem ir arī semināra grāds.
Vēl viena atšķirība starp Bībeles koledžu un semināru bieži ir konfesija. Ir dažāda veida Bībeles koledžas. Lai gan ir daži, kas ir cieši saistīti ar noteiktu baznīcu, daudzi citi ir starpkonfesionāli, koncentrējoties uz kopīgu Bībeles vēsturi, izņemot konkrētu baznīcas tradīciju. Semināri gandrīz vienmēr ir vienas konfesijas. Bībeles koledžas vai semināra izvēle daudzas reizes ir atkarīga no studenta piederības baznīcai.
Katrai kristīgajai konfesijai ir atšķirīgas prasības tās vadītājiem. Dažās baznīcās, piemēram, Romas katoļu baznīcā, priesterība ir paredzēta vīriešiem. Tādējādi katoļu semināri ir atvērti tikai vīriešiem, un piedāvātās nodarbības, kursi un grādi pēc būtības ir īpaši katoļticīgi. Semināri ievēro savas dibinātājkonfesijas mācības un parasti sagatavo studentus kalpošanai noteiktā draudzē.
Dažreiz skola piedāvā gan Bībeles koledžu, gan semināru. Abiem bieži būs kopīga mācībspēki, bet studenti parasti aprobežojas ar vienu programmu. Bībeles koledžas grāds var novest pie uzņemšanas seminārā, un to pašu skolu uzņemšana vienā universitātes pilsētiņā atvieglo pāreju. Tomēr parasti nav tiešas korelācijas starp Bībeles koledžas un semināra apmeklēšanu.