Gūžas cistu var ārstēt ar ķirurģisku izņemšanu vai drenāžu, ko papildina pretiekaisuma zāles; labākā ārstēšanas iespēja lielā mērā ir atkarīga no cistas veida. Var būt nepieciešama papildu ārstēšana atkarībā no cistas veidošanās pamatcēloņa. Ja izaugums attīstās, piemēram, fiziskas traumas rezultātā, pirms vai pēc cistas noņemšanas kauls ir jāpārbauda, vai nav sadzijušu ievainojumu. Pacientiem ar vēža cistām būs jāveic ārstēšana, lai novērstu recidīvu iespējamību. Dažos gadījumos cista plīsīs pati, un tai nav nepieciešama turpmāka ārstēšana ārpus šķidruma aizplūšanas.
Subhondrālas gūžas cistas ārstēšana parasti nav nepieciešama, jo šāda veida augšana ar laiku izzūd. Pacienti var lietot pretiekaisuma līdzekļus, lai mazinātu diskomfortu, kā arī izvairītos no jebkādām darbībām, kas varētu radīt spiedienu uz skarto zonu. Sinoviālajām cistām ir arī tendence laika gaitā sarukt, lai gan lielākā daļa pacientu izvēlas izaugumus ķirurģiski noņemt, lai novērstu to ataugšanu. Gadījumos, kad cista pārsprāgst pati, pacientam būs jāiztukšo atbrīvotais šķidrums no vietas. Tāpat kā ar subhondrālu gūžas kaula cistu, sinoviālo cistu var samazināt ar kortikosteroīdu palīdzību.
Pacientiem vajadzētu arī uzzināt, kas izraisīja izaugumu attīstību, un risināt šīs problēmas. Piemēram, ja tāda veidojas osteoporozes sākumā, pacientam jāveic nepieciešamās dzīvesveida korekcijas, lai pārvaldītu stāvokli un novērstu turpmāku izaugumu veidošanos. Savukārt pacienti ar cistām, kas attīstās reimatoīdā artrīta dēļ, var novērst cistu attīstību ar pretreimatisma līdzekļu palīdzību. Smagas fiziskās aktivitātes samazināšana, kas ietekmē gurnus, var arī palīdzēt novērst turpmāku augšanu. Pacienti var izvēlēties veikt adatas aspirācijas biopsijas, lai iegūtu skaidrāku cistu diagnozi.
Medicīnas speciālisti iesaka pacientiem pēc iespējas ātrāk veikt gūžas cistas operāciju, ja tiek atklāts vēzis. Tas var palīdzēt novērst vēža izplatīšanos visā gūžā un pārējā ķermeņa daļā, ja tiek noteikts, ka šī vieta ir sākuma punkts. Dažādas ārstēšanas metodes, piemēram, ķīmijterapija un staru terapija, ir arī dzīvotspējīgi risinājumi, ja pacients atsakās no operācijas vai ja vēzis ir sācies citur organismā. Regulāri jāveic uzraudzība, lai pārliecinātos, vai vēzis ir veiksmīgi nodots remisijai.