Reproduktīvās sistēmas anatomija ietver tos orgānus, audus un asinsvadus, kas piedalās vairošanās procesā vai viena vai vairāku pēcnācēju radīšanā no vīrieša un sievietes vecāka. Atšķirībā no citām cilvēka ķermeņa sistēmām, vīriešu un sieviešu reproduktīvās sistēmas anatomija ievērojami atšķiras. Sievietēm galvenie orgāni ir maksts, dzemde un olnīcas, savukārt vīriešiem galvenie reprodukcijas orgāni ir dzimumloceklis, sēklinieki un sēklinieki. Olvadi un dzemdes kakls savieno šos orgānus sieviešu reproduktīvajā sistēmā, savukārt vīriešiem asinsvadi ietver epididīmu un asinsvadus. Diskusijā par reproduktīvās sistēmas anatomiju jāiekļauj arī tās mazākās vienības, spermas šūna vīriešiem un olšūna vai olšūna sievietēm.
Gan vīriešiem, gan sievietēm reproduktīvās sistēmas anatomiju var iedalīt ārējos un iekšējos orgānos. Sieviešu ārējo orgānu bieži sauc par maksts. Tomēr šis orgāns tehniski ir iekšējais kanāls, kas vada vīriešu spermu dzemdē.
Sieviešu ārējie dzimumorgāni ietver aizsargājošās kaunuma lūpas, lielās krokas, kas aptver atlikušos ārējos orgānus: mazās kaunuma lūpas, klitoru un Bartolīnas dziedzerus. Mazās kaunuma lūpas ir mazākas krokas, kas aizsargā maksts atveri, kā arī urīnizvadkanāla vai urīnceļu atveri. Klitors ir mazs, ar nerviem piepildīts orgāns priekšā maksts atverei, kas ir homologs vīriešu dzimumloceklim. Sievietēm ir arī Bartolīna dziedzeri, kas izdala sekrēcijas, kas nodrošina sākotnējo dzimumlocekļa eļļošanu, ieejot makstī.
Vīriešu reproduktīvās sistēmas ārējie orgāni ir dzimumloceklis, sēklinieki un sēklinieki. Dzimumloceklis ir orgāns, kas ļauj spermai sasniegt sievietes olšūnu dzimumakta vai iekļūšanas maksts laikā. Blīvs ar asinsvadiem, tas uzbudinājuma laikā kļūst erekts, jo šajā reģionā strauji plūst asins plūsma, ļaujot tai iekļūt sievietes makstī. Aiz dzimumlocekļa atrodas sēklinieku maisiņš, ārējais maisiņš, kas satur un aizsargā savienotos sēkliniekus. Šie sēklinieki vai sēklinieki ir orgāni, kas ražo spermu, vīriešu reproduktīvās šūnas.
Reproduktīvās sistēmas anatomijai jāiekļauj arī iekšējie vairošanās orgāni. Sievietēm tās ir maksts, dzemde un olnīcas. Maksts ir tikai dažu collu dziļš paplašināms kanāls, kas ved uz dzemdi un caur kuru iziet mazulis dzemdību laikā. Maksts aizmugurē ir dzemdes kakls, atvere, caur kuru spermatozoīdi nonāk ceļā uz dzemdi. Dzemde ir vieta, kur auglis aug grūtniecības laikā, un tā var arī ievērojami paplašināties.
Abās augšējās dzemdes pusēs olvadi ved uz olnīcām, sieviešu dzimuma orgāniem. Šie orgāni ražo olšūnas vai olas, kas katru mēnesi izdalās, lai tās apaugļotu ar vīriešu spermu. Ja tas nenotiek, tie tiek izvadīti no ķermeņa kopā ar dzemdes gļotādu, kur apaugļotā olšūna iesūksies pēc ieņemšanas menstruāciju veidā.
Vīriešu reproduktīvās sistēmas iekšējā anatomija ietver urīnizvadkanālu, vas deferens un epididīmu. Sākot ar atvērumu dzimumlocekļa galā, urīnizvadkanāls ir iekšējais trauks, kas izvada no ķermeņa spermu, spermu saturošu šķidrumu un urīnu. Tas ved uz vas deferens, cauruli, kas nogādā spermu urīnizvadkanālā.
Epididymis ir sēklinieku uzglabāšanas vienība. Tas atrodas aiz katra sēklinieka un ir caurule, kurā atrodas sēklinieku ražotās spermas šūnas, līdz tās ir pietiekami nobriedušas, lai varētu apaugļot sievietes olšūnu. Uzbudinājuma laikā šīs šūnas no epididīma tiek atbrīvotas vadu zarnās, kur tās sajaucas ar sēklu šķidrumu, veidojot spermu, kas ejakulācijas laikā tiks izlaista sievietes makstī.