Pašreizējais Ziemeļkarolīnas štata karogs tika pieņemts 1885. gada martā. Ģenerālis Džonstons Džounss ir atbildīgs par likumprojekta ierosināšanu, kas mainīja Ziemeļkarolīnas štata karogu no tā iepriekšējā dizaina, kas attēloja Ziemeļkarolīnu pilsoņu kara laikā. Pašreizējais Ziemeļkarolīnas karogs parāda platu, horizontālu sarkanu augšējo joslu virs platas, horizontālas baltas apakšējās joslas. Vertikāla zila josla rotā karoga kreiso pusi, un uz šīs joslas atrodas zelta burti NC, kas atdalīti ar baltu zvaigzni. Virs šiem burtiem zelta karogs melniem burtiem pasludina Mēklenburgas Neatkarības deklarācijas datumu, 20. gada 1775. maiju. Līdzīgs reklāmkarogs zem burtiem NC parāda Halifax Resolves datumu, 12. gada 1776. aprīli.
Tiek uzskatīts, ka pirmais, kas ierosināja pieņemt Ziemeļkarolīnas štata karogu, bija pulkvedis Džons D. Vitfords. Tiek ziņots, ka viņš savu priekšlikumu izteica 20. gada 1861. maijā, dienā, kad Ziemeļkarolīna nobalsoja par atdalīšanos no Amerikas Savienotajām Valstīm un pievienošanos Amerikas Konfederācijas Valstīm. Lai gan Ziemeļkarolīnas konvencija apstiprināja Vitfordas karoga priekšlikumu, grupa galu galā noraidīja viņa dizainu. Tā vietā viņi pieņēma Viljama Jarla Brauna radīto dizainu. Šis dizains tika oficiāli pieņemts Ziemeļkarolīnas konvencijā 22. gada 1861. jūnijā, un tas tika izmantots līdz pat pilsoņu kara beigām.
Ziemeļkarolīnas sākotnējais štata karogs pēc dizaina ir ļoti līdzīgs pašreizējam Ziemeļkarolīnas štata karogam. Sarkano un zilo joslu novietojums, kā tie redzami uz valsts modernā karoga, tika mainīti. Vertikālā josla pa kreisi bija sarkana, bet horizontālā augšējā josla pa labi bija zila. Sarkanajā vertikālajā joslā parasti bija balta zvaigzne.
Virs šīs zvaigznes parasti bija rakstīts Mēklenburgas Neatkarības deklarācijas datums, bet zem tās parasti bija rakstīts Ziemeļkarolīnas oficiālās pēctecības datums no ASV, 20. gada 1861. maijs. Vēsturnieki uzskata, ka Ziemeļkarolīna bija viens no diviem konfederācijas štatiem. Amerikas pilsoņu kara laikā saviem pulkiem izsniedz oficiālus valsts karogus.
Lielākā daļa uzskata, ka nepieciešamība pēc jauna Ziemeļkarolīnas štata karoga kļuva skaidra, kad Ziemeļkarolīna pēc Amerikas pilsoņu kara atkal pievienojās ASV. Ziemeļkarolīnas štats turpina izmantot 1885. gada martā pieņemto pamata karoga dizainu. 1991. gada štata likumdevēja akts pagarināja Ziemeļkarolīnas štata karogu un noņēma komatus no uz tā attēlotajiem datumiem.