Dabiskā akmens flīzes var būt jebkura veida flīzes, kas izgatavotas no akmens, kas ir novākts no zemes. Šāda veida flīzes bieži tiek novērtētas vai nu to izturības, unikālā skaistuma vai abu veidu dēļ. Dažādiem dabīgā akmens flīžu veidiem ir dažādas īpašības — no cietības līdz izskatam — un tās visas var sagriezt noteiktos izmēros un formās. Starp dažādiem veidiem ir granīts, marmors, šīferis un travertīns.
Dažas dabiskā akmens flīzes ir izgatavotas no granīta akmens. Granīts ir magmatisks iezis un ir otrs cietākais materiāls uz Zemes, blakus dimantam. Tas ir dažādās krāsās, no melnas līdz rozā; dažas šķirnes ir arī raibas. Tā cietība, krāsu palete un spožā apdare padara to par ideālu flīžu izvēli dažādām jomām, tostarp grīdām, darba virsmām, aizmugures vietām un dušām.
Marmoru var izmantot arī dabīgā akmens flīžu izgatavošanai. Tas ir metamorfisks iezis, kas sastāv no kalcīta. Materiāls ir pieejams dažādās krāsās, piemēram, baltā, pelēkā un zaļā krāsā, un tam bieži ir svītras, kas iet cauri. Tāpat kā granīta flīzes, arī marmora flīzes parasti tiek izmantotas grīdas segumam, darba virsmām, aizmugures vietām un dušām, taču materiāls ir mazāk izturīgs nekā granīts.
Šīferis ir vēl viens dabīgā akmens flīžu veids. Šāda veida metamorfie ieži sastāv no vulkāniskajiem pelniem vai māliem. Tas ir izturīgs akmens, kas piedāvā mazāk izteiksmīgu, taču pievilcīgu izskatu nekā granīts un marmors. Lai gan šīferis visbiežāk ir pelēkā krāsā, tas var būt arī sarkans, zaļš, violets vai bēšs. Šīferis ir neslīdošs un lēni uzsūc ūdeni, tāpēc šīfera flīzes bieži izmanto grīdas vai jumta segumos, taču tās var izmantot arī citām flīžu ieklāšanas vajadzībām.
Nogulumiežu kaļķakmens iezis, kas pazīstams kā travertīns, ir vēl viens materiāls, ko izmanto dabiskā akmens flīzēm. Apstrādājot travertīnu, tas ir vai nu šķērsgriezis ar dabīgo akmens graudiņu, radot vienmērīgu izskatu un krāsu; vai arī tas ir izgriezts ar dzīslu, vai izgriezts cauri daudziem iežu slāņiem, piešķirot tam svītrainu izskatu. Šis materiāls ir neitrālos ziloņkaula, bēšā un zelta toņos. Tas ir porains, kas nozīmē, ka tas, visticamāk, notraipīs, tāpēc travertīna flīzes var nebūt ideāli piemērotas izmantošanai darba virsmās, bet drīzāk aizmugures vai dušas telpas izmantošanai.