Anaerobā notekūdeņu attīrīšanā izmanto bioloģiskos aģentus vidē, kas nesatur skābekli, lai no notekūdeņiem noņemtu piemaisījumus. Pēc šādas apstrādes ūdeni var droši izlaist atpakaļ vidē. Procesā izmantotie bioloģiskie aģenti ir mikroorganismi, kas patērē vai sadala bioloģiski noārdāmos materiālus dūņās vai notekūdeņu cietajā daļā pēc to filtrēšanas no piesārņota ūdens.
Anaerobā notekūdeņu attīrīšana ir pazīstama arī kā anaerobā pārstrāde mikroorganismu darbības dēļ. Tas ir, tie būtībā “sagremo” piesārņotās ūdens daļas. Lielisks veids, kā samazināt organisko vielu atlikumu tādās lietās kā notekūdeņi un pārtikas atliekas, anaerobā gremošana parasti ir jebkuras bioloģiskās notekūdeņu attīrīšanas sistēmas sastāvdaļa.
Parasti anaerobais process notiek noslēgtās tvertnēs, kas atrodas virs vai zem zemes. Dūņu sadalīšanās sākumposmā mikroorganismi, kas pārsvarā ir baktērijas, pārvērš atkritumus organiskās skābēs, amonjakā, ūdeņradi un oglekļa dioksīdā. Anaerobās notekūdeņu attīrīšanas pēdējās stadijās dūņu atliekas ar vienšūnas mikroorganismu, kas pazīstams kā metanogēns, pārvērš biogāzē, kas sastāv no metāna un oglekļa dioksīda.
Papildu ieguvums no anaerobās notekūdeņu attīrīšanas ir gāzu emisiju samazināšana. Biogāzi, kas rodas notekūdeņu anaerobās attīrīšanas rezultātā, faktiski var izmantot un izmantot kā alternatīvu enerģijas avotu ēdiena gatavošanai, apgaismojumam, apkurei un dzinēju degvielai. Citiem vārdiem sakot, uztverot un izmantojot anaerobās pārstrādes rezultātā radušos metānu un oglekļa dioksīdu, biogāze netiek izlaista atmosfērā.
Daudzi zinātnieku aprindās uzskata, ka liela metāna un oglekļa dioksīda, ko sauc arī par siltumnīcefekta gāzēm, koncentrācija Zemes atmosfērā veicina globālās sasilšanas procesu. Šī teorija, kas pazīstama kā siltumnīcas efekts, apgalvo, ka šīs gāzes atmosfērā aiztur saules siltumu, tādējādi paaugstinot globālo temperatūru. Lai gan teorija ir izraisījusi zināmas pretrunas, biogāzes izmantošanai kā alternatīvai fosilajam kurināmajam ir daži praktiski pielietojumi.
Jaunattīstības valstīs ir pieejamas valdības finansētas programmas, lai palīdzētu apgādāt atsevišķas mājas un saimniecības ar biogāzi, kas iegūta, veicot anaerobās fermentācijas procesu uz vietas. Apvienoto Nāciju Organizācija arī piedāvā finansējumu anaerobās gremošanas programmām jaunattīstības valstīs, ja ir pieejami pierādījumi par samazinātu gāzu emisiju.
Amerikas Savienotajās Valstīs notekūdeņu anaerobā attīrīšana parasti ir daļa no sadzīves notekūdeņu attīrīšanas iekārtas. Tomēr anaerobo fermentāciju izmanto arī vienas ģimenes mājas apgabalos, kas nav savienoti ar komunālo sistēmu, un uzņēmumi ar notekūdeņu attīrīšanas iekārtām uz vietas.