Zobārsti bieži izraksta antibakteriālu mutes skalojamo līdzekli, lai samazinātu mikrobu daudzumu mutē, kas izraisa gingivītu, kas ir izplatīta smaganu slimība. Bezrecepšu versijā antibiotiku vietā tiek izmantots liels daudzums alkohola, un tam ir vairāk antiseptiska iedarbība. Lai gan lielākā daļa šo perorālo zāļu ir drošas, var rasties blakusparādības. Antiseptiski bezrecepšu skalošanas līdzekļi ir pieejami tiem, kam nav nopietnu slimību un vēlas izvairīties no alkohola lietošanas.
Lielākā daļa cilvēku lieto mutes skalojamo līdzekli halitozes vai sliktas elpas gadījumā, ko galvenokārt izraisa baktēriju darbība uz aplikuma nogulsnēm vai daļiņām. Tie izdala sēra savienojumus, kas izraisa nepatīkamu smaku. Halitozi var izraisīt arī ļoti sausa mute, smēķēšana vai veselības traucējumi, piemēram, diabēts un elpceļu slimības. Cilvēkiem ar pastāvīgu halitozi jāredz ārsts, lai pārliecinātos, ka pamata problēmu var ārstēt.
Nopietnāku slimību, piemēram, gingivīta, gadījumā zobārsti var izrakstīt antibakteriālu mutes skalojamo līdzekli, kā arī uzlabot mutes dobuma higiēnu. Šie skalošanas līdzekļi var saturēt tetraciklīnu, antibiotiku, kas iznīcina baktērijas, heksetidīnu, kas mazina kairinājumu un asiņošanu, un dažreiz arī anestēzijas līdzekli pret sāpēm. Nistatīns ir pretsēnīšu līdzeklis, ko bieži ordinē Candida, rauga sēnīšu organismam, kas izraisa piena sēnīti.
Ir konstatēts, ka hlorheksidīna glikonāts, antiseptisks līdzeklis gan antibakteriālajos mutes skalošanas līdzekļos, gan bezrecepšu veidā, kavē aplikuma mikrobu augšanu. Rezultāti ilgst tikai dažas stundas. Antiseptiskajai skalošanai ir jāpapildina laba mutes dobuma higiēna, piemēram, regulāra zobu tīrīšana un zobu diegs, nevis jāaizstāj. Regulāra aprūpe palīdzēs samazināt halitozes gadījumu, ko nav izraisījis cits veselības stāvoklis. Antibakteriāls mutes skalojamais līdzeklis, kas satur antibiotikas, ir reti nepieciešams, tomēr, lai ārstētu biežākos sliktas elpas cēloņus.
Daudzi bezrecepšu mutes skalojamie līdzekļi satur spirtu, kas iznīcina baktērijas, bet izžāvē mutes gļotādu. Daži zinātnieki uzskata, ka alkoholisks mutes skalojamais līdzeklis veicina mutes vēzi, jo hroniski dzērājiem novēro augstāku par vidējo rādītāju. Ir zināms, ka hroniski alkoholiķi dažreiz ļaunprātīgi izmanto mutes skalojamo līdzekli, ja alkohols citā veidā nav pieejams un var uzņemt vairāk nekā vidusmēra lietotājs. Kopš 2011. gada nav pierādīta galīga saikne starp augsta alkohola saturoša mutes skalošanas līdzekļa lietošanu un mutes vēzi.
Antibakteriālajam mutes skalojamajam līdzeklim var būt tādas pašas blakusparādības kā perorālai lietošanai tablešu veidā. Dažiem cilvēkiem ir alerģija pret tetraciklīnu un citām antibiotikām. Viņiem var rasties nopietna reakcija ar sejas un rīkles pietūkumu un elpošanas traucējumiem. Ir zināms, ka hlorheksidīns, ilgstoši lietojot, krāso zobus. Pacientiem var būt arī kuņģa darbības traucējumi, caureja un slikta garša mutē.
Ja pacientiem nav nepieciešams antibakteriāls mutes skalojamais līdzeklis, ir alternatīvas spirta antiseptiskiem līdzekļiem. Veselības pārtikas veikalos pieejamie augu preparāti satur garšaugus vai ksilītu, dabisku saldinātāju ar zemāku glikēmisko indeksu nekā cukuram. Daudzi cilvēki zvēr pie vienas tējkarotes sāls šķīdumu vienā glāzē silta ūdens kā ekonomisku un efektīvu skalošanas līdzekli, lai ārstētu iekaisis kakls vai vieglas mutes traumas un infekcijas. Zobārsti var ieteikt arī drošus, alkoholu nesaturošus preparātus bērniem.