Hlorheksidīns ir ķīmiska viela ar antiseptiskām īpašībām, un tā parasti ir pietiekami maiga, lai medicīnas un zobārstniecības speciālisti varētu lietot tieši uz pacientu ādas. Šī ķīmiskā viela var būt sastāvdaļa daudzos dažādos produktu veidos, piemēram, hlorheksidīna gēlā. Turklāt ārstēšanai ar hlorheksidīna gelu var būt piemēroti dažādi apstākļi, sākot no mutes dobuma infekcijām līdz maksts infekcijām.
Gan baktērijas, gan sēnītes ir neaizsargātas pret hlorheksidīna gēlu. Viela nav antibiotika vai zāles, bet gan antiseptisks līdzeklis. Hlorheksidīns var iznīcināt mikrobus, ar kuriem tas nonāk saskarē, taču tas nav drošs nekam citam, kā tikai lietošanai uz ķermeņa epitēlija daļām. Piemērotas vietas, kas ne vienmēr ir āda, bet ir pietiekami spēcīgas, lai tās nesabojātu hlorheksidīns, ir mutes iekšpuse un dzimumorgānu ārējās zonas.
Zobu higiēna ir viena no jomām, kurā var izmantot hlorheksidīna želeju. Tas galvenokārt ir paredzēts cilvēkiem, kuriem ir sēnīšu infekcijas mutē vai kuri cieš no tādām problēmām kā mutes čūlas. Gelu var lietot tāpat kā zobu pastu. Tomēr hlorheksidīns slikti sajaucas ar parasto zobu pastu, tāpēc lietotājiem tās jāglabā atsevišķi.
Infekciju piemēri, ko var palīdzēt mazināt iekšķīgi lietojamais gels, ir rauga infekcijas piena sēnīte un baktērijas, kas var izraisīt zobu samazinājumu vai smaganu iekaisumu. Ķīmiskā viela var īslaicīgi ietekmēt muti, izņemot mikrobu populāciju nogalināšanu. Šīs iespējamās blakusparādības ietver pārejošu zobu krāsas maiņu, kairinātu ādu mutē un lietotājam var rasties dedzināšanas sajūta uz mēles.
Cita želejas forma ir paredzēta lietošanai uz dzimumorgāniem sievietēm, kurām attīstās maksts infekcijas. Šāda veida infekcijas ir raksturīgas daudzām sievietēm, dažas no tām ir bakteriālas infekcijas, bet citas – rauga infekcijas dēļ. Tā kā hlorheksidīns spēj mērķēt uz abiem stāvokļu veidiem, gēls var būt noderīgs šādos gadījumos. Iespējamais ieguvums no šāda veida ārstēšanas salīdzinājumā ar antibiotiku vai pretsēnīšu ārstēšanu ir tāds, ka zāles var mazāk traucēt normālu mikrobu populāciju.
Turklāt, tā kā hlorheksidīns pirmkārt un galvenokārt ir antiseptisks līdzeklis, tam ir papildu pielietojums kā ādas tīrīšanas līdzeklis. Šāda veida želejas izstrādājumi ir noderīgi, piemēram, ādas dezinfekcijai pirms injekcijām. Daži produkti satur arī ādu nejutīgu līdzekli; piemēram, anestēzijas līdzeklis lidokaīns.