Metabolomika ir jauna nozare analītiskajā bioķīmijā, kas saistīta ar vielmaiņu — procesu, kurā pārtikas enerģija tiek pārvērsta mehāniskajā enerģijā vai siltumā. Metabolisma blakusprodukti, kas pazīstami kā metabolīti, tiek ražoti bioloģiskos paraugos, piemēram, urīnā, siekalās un asins plazmā. Metabolomika attiecas uz šo metabolītu profilu izpēti, kas iegūti bioloģiskajos paraugos. Augu bioloģijas gadījumā metabolītu profilēšanai tiek izmantoti specifiski audu paraugi. Metabolomika pieauga kopā ar genomiku un proteomiku kopš 1990. gadu vidus, pateicoties Cilvēka genoma projektam, projektam, kura mērķis ir kartēt cilvēka gēnu sistēmu.
Šūnu aktivitātes procesus, piemēram, šūnu signālu pārraidi, enerģijas pārnesi un saziņu starp šūnām, kontrolē metabolīti. Metabolisms ir visu metabolītu kopums šūnā noteiktā laika posmā. Cilvēkiem ir daudz dažādu šūnu ar dažādiem metabolomiem, bet metabolomika nodarbojas ar metabolītu ar zemu molekulmasu, piemēram, lipīdu, cukuru un aminoskābju, izpēti. Tās sauc arī par mazām molekulām. Ģenētiskus traucējumus, slimības vai vides traucējumus var izskaidrot ar vielmaiņas izmaiņu izpēti. Tādējādi metabolītu, proti, metabolomikas, izpēte var palīdzēt diagnosticēt slimības vai izpētīt saindēšanās vielu ietekmi.
Metabolisma pētījumos tiek izmantotas divas papildu pieejas: vielmaiņas profilēšana un vielmaiņas pirkstu nospiedumu noņemšana. Metabolisma profilēšanā noteiktas klases metabolītu mērīšanai izmanto kvantitatīvās analītiskās metodes. Metabolisma pirkstu nospiedumu noņemšanā pirkstu nospiedumus salīdzina, lai noteiktu, vai metabolīti ir mainījušies slimības vai toksīnu iedarbības dēļ. Lai veiktu šāda veida salīdzinājumu, var izmantot hromatogrammas un statistikas metodes. Tā ir daļēji kvantitatīvā metode, ko faktiski var izmantot plašam metabolītu klāstam. Metabolmiku var pētīt, kombinējot vielmaiņas profilēšanu un pirkstu nospiedumus.
Pētnieki sagaida, ka metabolomika var palīdzēt veselības aprūpei daudzos veidos. Tai jāspēj ražot drošākas zāles un labāk identificēt cilvēku grupas, kuras varētu gūt labumu no narkotikām. Metabolomika var arī palīdzēt diagnosticēt slimības un uzraudzīt dažādas veselības ārstēšanas metodes. Integrēta ar proteomiku un genomiku, metabolomika tiek izmantota, piemēram, lai noskaidrotu, kāpēc daži cilvēki ir jutīgāki pret noteiktu zāļu izraisītiem aknu bojājumiem. Paredzams, ka šim laukam būs svarīga loma sistēmu bioloģijā ilgtermiņā, un īstermiņā tas nodrošinās biomarķierus slimību un toksīnu iedarbības pētīšanai.