Helikoptera lidojumu instruktors ir atbildīgs par to, lai studenti iemācītu lidot ar helikopteru. Gan zemes skola, gan faktiskā lidojumu apmācība ir helikoptera lidojumu instruktora pārziņā. Bieži vien reģistrēts un licencēts helikoptera pilots nolemj kļūt par instruktoru. Papildus apmācību, lai kļūtu par instruktoru, veic sertificēts helikoptera lidojumu instruktors. Daudzi lidojumu instruktori dala laiku starp lidojumu apmācību helikopterā un lidmašīnā, kas paredz, ka instruktoriem ir jābūt sertificētiem abu veidu lidmašīnās.
Bieži vien pirmais solis studenta interesēs kļūt par pilotu nāk pirmā lidojuma rezultātā. Daudzos gadījumos pirmo lidojumu ar helikopteru veic sertificēts helikoptera lidojumu instruktors. Instruktors aizvedīs pasažieri lidojumā un laiku pa laikam ļaus pasažierim pārņemt vadību pār lidmašīnu. Tomēr tā ir ierobežota kontrole, jo instruktors reti nodod pilnīgu kontroli pār kuģi neapmācītam operatoram. Helikoptera lidojumu instruktors cenšas apmierināt pasažiera interesi kļūt par licencētu pilotu, bieži pārvēršot pasažieri par potenciālo studentu.
Lielākajai daļai lidojumu skolu studentiem ir jāpabeidz apmācība uz zemes. Šajā apmācības komponentā helikoptera lidojumu instruktors izglīto studentus par laika apstākļiem, kā arī helikoptera vadības ierīcēm un lidojuma īpašībām. Citas ļoti svarīgas jomas, kas ir ietvertas pilotu apmācības pamatskolas daļā, ietver mācīšanos lasīt topogrāfiskās kartes un mācīšanos identificēt augstas konstrukcijas, piemēram, antenas, kokus un ūdenstorņus. Visi garākie objekti noteiktā apgabalā ir skaidri uzskaitīti pilota kartē. Studentam jābūt izglītotam par briesmām, saskaroties ar elektropārvades līnijām un antenām, kā arī par jebkādām ārkārtas darbībām, kas jāveic, nejauši saskaroties ar kādu no šiem objektiem.
Kad skolas uz zemes daļa ir pabeigta, instruktors vadīs studentus cauri faktiskajai apmācības lidojuma daļai. Šajā laikā instruktors liks studentiem doties helikoptera lidojumā un apgūt daudzās lidmašīnas iespējas. Studentiem progresējot apmācībā, helikoptera lidojumu instruktors ļaus studentiem pārņemt kuģa vadību un mēģināt lidot. Šajā periodā instruktors parasti satver vadības ierīces, lai pārvarētu jebkādus ārkārtas apstākļus, kas var rasties studenta lidojuma laikā. Kad students ir pabeidzis visu apmācību sesiju un ir parādījis atbilstošu zināšanu līmeni, lai droši vadītu helikopteru, lidojumu instruktors ļaus studentam veikt solo lidojumu.