Lai gan pērkons pats par sevi parasti nav bīstams, izņemot ārkārtīgi retus apstākļus, pērkona negaiss ir, jo tas ir saistīts ar meteoroloģiskām parādībām, piemēram, zibens, kas var būt ļoti bīstams. Ja pamanāt, ka tuvojas pērkona negaiss, mēģiniet slēpties iekštelpās un atturēties no tālruņa vai citu elektroierīču lietošanas, vienlaikus atrodoties tālāk no logiem. Ja vētras laikā esat pieķerts ārā, noliecieties pēc iespējas zemāk pie zemes un izvairieties no vientuļiem kokiem vai metāla, kas var piesaistīt zibeni. Ja kādu pērkona negaisa laikā iespēris apgaismojums, pēc iespējas ātrāk meklējiet medicīnisko palīdzību.
Vairākas lietas padara pērkona negaisus bīstamus. Pirmais ir zibens, kas pavada lielāko daļu pērkona negaisu. Zibens ir elektriskā izlāde, kas rodas pozitīvo un negatīvo daļiņu atdalīšanas rezultātā, kas notiek daudzās vētru sistēmās, mākoņiem grūstoties laikapstākļos. Ja zibens spēriens, cilvēks var iet bojā vai gūt smagus savainojumus, turklāt zibens sabojās arī mājas un citus īpašumus. Lai gan nāve vai smagi ievainojumi zibens spēriena rezultātā ir reti, tie tomēr notiek.
Pērkona negaiss ir saistīts arī ar stipru lietu, vēju un krusu. Galvenais nāves cēlonis, kas saistīts ar pērkona negaisiem, patiesībā ir pēkšņi plūdi, kas rodas, ja ļoti īsā laika periodā nokrīt liels lietus daudzums. Dažos apgabalos pēkšņu plūdu risks ir lielāks nekā citās, taču, ja esat nokļuvis pērkona negaisā, uzmanieties, lai pēkšņu plūdu gadījumā neveidotos gravas un līstes, kas var uzkrāt ūdeni. Stiprs vējš var nodarīt kaitējumu īpašumam un nogāzt kokus un elektropārvades līnijas, potenciāli radot apdraudējumu, savukārt krusa var būt nāvējoša, ja gabali ir pietiekami lieli, vai vismaz radīt nopietnus sasitumus.
Dažās vietās viesuļvētras ir saistītas ar pērkona negaisu. Lai gan tas notiek ne vienmēr, viesuļvētra var būt ļoti bīstams tajā noķertajiem cilvēkiem, un tas var veicināt īpašuma bojājumus, ja tas kļūst pietiekami liels. Ja dzīvojat apgabalā, kurā ir nosliece uz viesuļvētrām, pērkona negaisa laikā ir jāmeklē patvērums pagrabā, lai izvairītos no potenciāli postošas sajūtas, ko izraisa viesuļvētra.
Ja jums ir mazi bērni, pārliecinieties, ka viņi saprot pērkona negaisa drošību, it īpaši, ja dzīvojat reģionā, kur pērkona negaiss ir bieži. Ņemiet vērā, ka zibens var trāpīt arī nejauši tālu no pērkona negaisa, tāpēc, ja dzirdat vai redzat pērkona negaisu, jums jāveic pasākumi, lai aizsargātu sevi. Varat arī apsvērt iespēju valkāt ausu aizsargus, jo pērkons ar augstu decibelu līmeni var ietekmēt jūsu dzirdi vai atstāt jūs uz vairākām dienām zvanot ausīs.