Sterilizācija zobārstniecībā ir ļoti svarīga, un zobārsti un zobārsta palīgi parasti tīra un dezinficē lielāko daļu virsmu savos birojos un procedūru telpās, lai palīdzētu novērst baktēriju izplatīšanos. Kad vien iespējams, tiek izmantoti arī vienreizējās lietošanas zobārstniecības piederumi. Instrumentus, kas nav vienreiz lietojami, parasti notīra ar rokām un ievieto mašīnā, kas pazīstama kā autoklāvs. Pēc tam šī iekārta dezinficē instrumentus, izsmidzinot tos ar ļoti augsta spiediena tvaiku, kas nogalina lielāko daļu mikroorganismu. Jebkuri instrumenti, kurus nevar pakļaut lielam karstumam vai mitrumam, parasti tiek dezinficēti ar ķīmiskām vielām.
Tā kā daudzas baktērijas var pārnest, vienkārši pieskaroties piesārņotām virsmām, zobārsti un zobārsta palīgi parasti ļoti rūpīgi dezinficē virsmas savos birojos un ārstniecības telpās. Cietas virsmas, piemēram, letes un izlietnes, parasti noslauka ar antibakteriālu aerosolu. Arī zobārstniecības krēsli parasti ir pārklāti ar vienreizējās lietošanas papīra pārvalkiem, kas tiek izmesti pēc katra pacienta. Zobārsti un viņu palīgi arī parasti valkā aizsargbarjeras, piemēram, cimdus un sejas maskas, lai palīdzētu novērst baktēriju izplatīšanos saviem pacientiem.
Vienreizlietojamie zobārstniecības instrumenti un piederumi ir daži no vissvarīgākajiem priekšmetiem, kad runa ir par sterilizāciju zobārstniecībā. Daži vienreizējās lietošanas zobārstniecības piederumi ietver priekšautiņus un maskas, kas iesaiņotas sterilā iepakojumā. Kad tie tiek lietoti vienam pacientam, tie tiek vienkārši izmesti.
Instrumenti, kurus nevar izmest, piemēram, zobu urbji, parasti tiek pakļauti ļoti intensīvam zobu sterilizācijas procesam. Vispirms tos parasti enerģiski berzē ar rokām. To parasti veic ar karstu ūdeni un mazgāšanas līdzekli, un tas palīdz noņemt lielas daļiņas, piemēram, aplikumu. Tos var arī ievietot vibrējošā paplātē, kas piepildīta ar tīrīšanas šķīdumu, kas var palīdzēt noņemt ļoti mazas daļiņas.
Sterilizācija zobārstniecībā ietver arī instrumentu neredzamo mikrobu nogalināšanu. Autoklāvi ir iekārtas, ko parasti izmanto sterilizācijas laikā zobārstniecībā. Šīs iekārtas parasti ir izgatavotas no lieliem metāla cilindriem, un tās ir līdzīgas spiediena katliem. Kad instrumenti ir ievietoti autoklāvā, tos apsmidzina ar augstspiediena tvaiku. Augsts spiediens šīs iekārtas iekšpusē palīdz paaugstināt tvaiku līdz ļoti augstai temperatūrai, kas nepieciešama slimību izraisošo mikroorganismu iznīcināšanai.
Visi instrumenti, kurus nevar pakļaut mitrumam vai intensīvam karstumam, jāsterilizē ar citām metodēm. Ķimikālijas bieži tiek izmantotas sterilizācijas laikā arī zobārstniecībā. Dažas no ķimikālijām, ko izmanto, lai iznīcinātu baktērijas un sterilizētu zobārstniecības instrumentus, parasti ir uz joda vai spirta bāzes, jo abas šīs ķīmiskās vielas ir ļoti efektīvas baktēriju iznīcināšanā.