Avārijas niršana ir manevrs, ko zemūdene izmanto, lai steidzami ienirtu, parasti avārijas gadījumā. Galvenokārt izmantoja Otrā pasaules kara dīzeļelektriskajās zemūdenēs, pavēli nirt avārijā deva kapteinis, kad tika atklāts kontakts ar ienaidnieka virszemes vai gaisa kuģiem. Avārijas niršanas scenārijā priekšējās balasta tvertnes tiek appludinātas saistībā ar niršanas lidmašīnu izmantošanu, lai pēc iespējas ātrāk nolaistu zemūdeni. Ir ļoti svarīgi, lai visas lūkas būtu aizvērtas un noslēgtas, pirms zemūdene tiek iegremdēta avārijas niršanas laikā.
Vācu zemūdenes izmantotā metode, lai avārijas niršanas laikā nodrošinātu maksimālu iegremdēšanas ātrumu, ir likt visam pieejamajam personālam pārvietoties pēc iespējas tālāk uz priekšu. Svara pārnešana, kad viss personāls virzās uz priekšu, palīdz zemūdenei iekāpt ūdenī. Tas arī ātrāk novieto niršanas lidmašīnas zem ūdens virsmas, palīdzot paātrinātā kuģa avārijas niršanā. Periodiski un ekstremālās situācijās daži apkalpes locekļi laiku pa laikam tika atstāti augšpusē, zemūdenei iegrimstot dziļumā. Tas parasti izraisīja nāvi, kā arī apkalpes locekļu ķermeņus.
Tipiskais zemūdenes avārijas niršanas dziļums ir 90 metri jeb aptuveni 295 pēdas. Kad zemūdene ir sasniegusi šo līmeni, tā var izlīdzināties un sākt uzņemties kreisēšanas ātrumu. Pēc iegremdēšanas dīzeļelektriskajai zemūdenei bija jāizslēdz dīzeļdzinēji un enerģijas iegūšanai jāizmanto elektrisko akumulatoru motori. Izmantojot dīzeļdegvielas iegremdētā stāvoklī, dažu minūšu laikā tiks izmantots viss zemūdenē esošais gaiss. Elektromotori ir arī daudz klusāki nekā dīzeļi, kas palīdz zemūdenei kļūt slepenai, vienlaikus cenšoties izvairīties no ienaidnieka atklāšanas.
Mūsdienu kodolzemūdenes paliek iegremdētas gandrīz visu misijas laiku, padarot avārijas niršanu par nevajadzīgu vingrinājumu; tomēr visas zemūdenes apkalpes praktizē avārijas niršanu, ja, uzkāpjot uz virsmas, notiek sadursme ar citu kuģi vai objektu. Kad niršanas pavēli ir devis kuģa kapteinis, galvenais inženieris parasti ir atbildīgs par visa manevra organizēšanu un pabeigšanu. Veicot ātro niršanu, ir ļoti svarīgi, lai aizmugurējās balasta tvertnes būtu savlaicīgi appludinātas, lai kuģa aizmugure neizkļūtu no ūdens. Ja tas notiek, kuģis kļūst par sēdošu mērķi, kamēr tam atkal ir grūti atgūt impulsu, lai pabeigtu niršanu.