Ekspertu viedokļi par to, cik bieži jāmazgā jūrascūciņa, atšķiras. Daži cilvēki uzskata, ka jūrascūciņām vannošana nemaz nav vajadzīga, savukārt citi uzskata, ka ir svarīgi tās vannot vismaz reizi trīs līdz četros mēnešos. Jūrascūciņas ir dabiski tīri dzīvnieki, kas spēj sevi kopt, taču reizēm tās joprojām var kļūt netīras. Ja viņu būri netiek turēti tīri, ir daudz lielāka iespēja, ka tie būs pietiekami netīri, lai būtu jāmazgā vannā. Vislabāk būtu ievērot veterinārārsta ieteikumus par to, cik bieži peldēt jūrascūciņu, ja jūs esat īpaši ziņkārīgs.
Jums jāpatur prātā, ka pārāk bieža jūrascūciņas peldēšana var kairināt un izžūt tās ādu. Šī iemesla dēļ vannošanās, iespējams, ir jāsamazina līdz minimumam, ja jūs vispār nolemjat to darīt. Vannojoties jūrascūciņai, varat apsvērt iespēju tās kažokā izmantot šampūnu, kas nav parazīts, jo parazīti reizēm ir problēma šiem dzīvniekiem. Parazītu šampūnu parasti ieteicams lietot pat tad, ja neesat pārliecināts, vai jūsu jūrascūciņai ir parazīti, jo tos ne vienmēr ir viegli pamanīt. Lai gan daudzi cilvēki iesaka šos dzīvniekus nemazgāt vispār, lielākā daļa piekrīt, ka vannošanās ir svarīga, ja ir skaidrs, ka jūrascūciņu ir pārņēmuši parazīti.
Pat ja jūs nolemjat nemazgāt jūrascūciņu, jūs joprojām varat to notīrīt ar mitru, ziepju drānu, kad tas šķiet nepieciešams. Lai gan jūrascūciņas parasti ir dabiski tīras, dažkārt uz to kažokādas var būt izkārnījumi vai citi gruveši no būriem. Ja nolemjat tīrīt savu mājdzīvnieku, noteikti izmantojiet maigas ziepes, jo stingrākas ziepes var ļoti kairināt tā ādu.
Ja jūrascūciņas būris vienmēr būs tīrs, tas ievērojami samazinās vajadzību pēc vannas. Ja iespējams, pakaiši jāmaina katru dienu, un, iespējams, viss būris būs rūpīgi jātīra vismaz reizi nedēļā. Lai tīrītu būru, varat izmantot jebkāda veida tīrīšanas šķīdumu. Daži cilvēki izmanto parastās ziepes, bet citi atšķaida nelielu daudzumu hlora balinātāja ar ūdeni, lai efektīvi iznīcinātu baktērijas. Neatkarīgi no tā, ko izmantojat būra iztīrīšanai, pirms jūrascūciņas ievietošanas atpakaļ iekšā noteikti ļaujiet tam kārtīgi izvēdināties.