Metafizika ir plaša filozofijas studiju joma, kas cenšas izprast un klasificēt eksistences dziļāko būtību. Līdzīgi lielākā daļa lielāko reliģiju mēģina piedāvāt skaidrojumu par to, kā un kāpēc kaut kas un jo īpaši cilvēki pastāv pasaulē. Tāpēc metafizika un reliģija ir saistītas, jo reliģija bieži mēģina sniegt metafizisku esamības izpratni. Citi jautājumi, kas ir svarīgi gan metafizikai, gan reliģijai, ietver cilvēka prāta būtību, brīvo gribu un Dieva esamību un lomu.
Vienīgais faktors, kas visvairāk apvieno metafiziku un reliģiju, ir eksistences būtība fundamentālā līmenī. Piemēram, materiālistam ir metafizisks uzskats, ka visas lietas var saprast materiāli, nepievēršoties nekādiem pārdabiskiem spēkiem. Savukārt reliģiskie ticīgie mēdz uzskatīt, ka pasaule pastāv Dieva vai dievu dēļ. Panteistiskais skatījums uz metafiziku un reliģiju apgalvo, ka starp idejām par “Dievu” un “pasauli” nav reālas atšķirības.
Vēl viens svarīgs jautājums, uz kuru attiecas abi jēdzieni, ir brīvas gribas jautājums. Zinātniski nav zināms, vai cilvēkiem ir pilnīga kontrole pār savām darbībām un lēmumiem. Metafiziķi cenšas izpētīt un saprast, ko nozīmē “brīva griba” pretstatā determinismam un vai abus var saskaņot. Viņi arī cenšas sniegt racionālus argumentus, dažkārt izmantojot mūsdienu zinātni, par vai pret brīvo gribu. No otras puses, dažādas reliģijas paļaujas uz brīvu gribu vai determinismu kā savu ētisko sistēmu pamatu.
Teoloģija ir filozofijas apakšnodaļa, kas interesējas par Dieva un dievišķo izpēti. Tādējādi tas aicina sniegt ieguldījumu gan no metafizikas, gan reliģijas. Svarīgi jautājumi teoloģijā ietver Dieva esamību, iespēju pazīt Dievu un Dieva lomu Visuma radīšanā un vadīšanā. Daži metafiziķi, piemēram, apgalvo, ka Dieva nav vai ka ideja par “dievu” attiecas tikai uz bezpersonisku radītāju. No otras puses, reliģijas teologi bieži vien strīdas par personīgo Dievu vai par teoloģiskajiem uzskatiem, ko sniedz viņu īpašās reliģijas.
Šo jēdzienu izpēte ir balstīta uz daudziem dažādiem faktoriem, no kuriem daudzi ir iegūti no filozofijas, vēstures un reliģijas. Dažas reliģijas, piemēram, attur no reliģisko doktrīnu apšaubīšanas un veicina dogmatisku, nevis kritisku metafiziku. Savukārt akadēmiskajiem filozofiem ir tendence uzskatīt, ka visus metafizikas un reliģijas jautājumus var un vajag pētīt.