Japāņu mitoloģija galvenokārt griežas ap šintoistu reliģiju un ietver tūkstošiem dievu, dieviešu un garu. Patiesībā, saskaņā ar šintoistu uzskatiem, katram objektam dabā, no mazākās klints līdz lielākajam kokam, ir savs gars; tas nespeciālistam var padarīt izpratni par pārliecības sistēmas galvenajiem elementiem nedaudz nepārvaramu. Neskatoties uz lielo dievību skaitu japāņu mitoloģijā, dažas galvenās dievības spēlē lielu lomu, tostarp Amaterasu, Hachiman un Susano.
Šintoisma reliģijā dievības tiek sauktas par “kami”. Tomēr šis termins ir vairāk nekā tikai dievību nosaukums, tas arī apzīmē dzīvības spēku, kas, kā teikts, plūst cauri visām pasaules būtnēm un dabas gabaliņiem. Pēc nāves cilvēku gari kļūst par kami, un, lai to godinātu, ietekmīgākie pilsoņi bieži tiek apbedīti kādā no daudzajām svētnīcām, kas atrodamas visā Japānā, lai ticīgo dievbijība viņus sasniegtu.
Susano, vētru kami, ir neglābjami saistīta ar Japānas vidi. Japānu ieskauj ūdens, un dažreiz tas var būt īpaši skarbs, dodot ceļu spēcīgiem taifūniem un milzīgiem cunami. Japāna ir daļa no Klusā okeāna uguns gredzena — šis termins tiek lietots, lai aprakstītu apgabalu, kurā var rasties zemestrīces un vulkānu izvirdumi. Tiek uzskatīts, ka Susano maz rūpējas par zemi un tās cilvēkiem.
Amaterasu ir saule un auglības kami japāņu mitoloģijā un viens no vissvarīgākajiem kami. Viņai ir liela loma gaismas radīšanā, kas ļauj augt rīsu laukiem, kas ir viena no Japānas galvenajām kultūrām, katru sezonu. Tiek uzskatīts, ka viņas mazdēls Ninigi no Mikoto ir Džimmu Tenno, Japānas pirmā dievišķā imperatora, vectēvs. Kamēr Japānu vairs nepārvalda imperators, karaliskās ģimenes simboliskā loma tautai joprojām ir ļoti nozīmīga.
Hačimans galvenokārt ir kara un karotāju kami, taču viņu pielūdz arī tie, kas strādā zvejniecības un lauksaimniecības nozarē. Samuraji, augsti apmācītu un nikni lojālu japāņu karotāju grupa, meklē aizsardzību pie Hačimana. Viņš ir viena no populārākajām dievībām Japānā, un visā valstī viņam ir veltītas tūkstošiem svētnīcu.
Japāņu mitoloģijā ir arī daudz stāstu par ļaunajiem gariem, un lielākā daļa valstī veikto rituālu ir paredzēti, lai novērstu šo garu nodarīšanu. Viens populārs rituāls notiek pirms Jaungada dienas, kad japāņi tīra savas mājas un izmanto slotu, lai aizslaucītu ļaunos garus. Ciedru lapas var novietot arī virs japāņu mājas ieejas, lai pasargātu no Amazake-babaa — vecāka gadagājuma sievieti, kura nes slimības visiem, kas atver durvis, kad viņa klauvē.