Masaliņu imunizāciju vai vakcināciju, ko parasti ievada kopā ar citām masalu un cūciņu (MMR) vakcīnām, medicīnas aprindās uzskata par drošu, ja to lieto atbilstoši norādījumiem, lai gan nevienu vakcināciju nevar uzskatīt par 100% drošu. Ir noteiktas populācijas, kurām šo vakcināciju nevajadzētu saņemt, taču attiecīgajās populācijās sliktas reakcijas iespējamība ir niecīga. Medicīniskā ziņā ieguvumi ievērojami pārsniedz risku cilvēkiem, kuri atbilst vakcinācijas kritērijiem.
20. gadsimta beigās pieauga dziļas un pieaugošas bažas par MMR vakcinācijas drošību, īpaši saistībā ar 1998. gada publikāciju cienījamā Apvienotās Karalistes medicīnas žurnālā The Lancet, kurā tika norādīta tieša saikne starp vakcināciju un autismu. Šis pētījums, kas kopš tā laika ir diskreditēts un izņemts no medicīnas žurnāla, iepazīstināja ar viltotiem pētījumiem, kā tas ir pilnībā zināms. Turklāt, vakcinācijas rādītājiem samazinoties, autisma gadījumā netika novērota atbilstoša samazināšanās; gluži pretēji, likmes turpināja kāpt.
Viens no iemesliem bažām bija sastāvdaļa timerosāls, kas satur dzīvsudrabu, kas dažās valstīs tika pievienots kā konservants vakcīnai. Lielākajā daļā vietu, piemēram, ASV, Kanādā un Apvienotajā Karalistē, masaliņu imunizācija vairs nesatur šo piedevu. Nekad nebija pārliecinošu pierādījumu, ka tā klātbūtne izraisīja autismu vai citus traucējumus, taču ir atzīts, ka zināmas indes iedarbības samazināšana ir medicīniski saprātīga.
Pastāv patiesas bažas par imunizācijas pret masaliņām drošību, ja to lieto noteiktās populācijās. Grūtnieces nekad nedrīkst lietot šo vakcināciju, jo tā var pakļaut auglim masaliņu infekciju un izraisīt augļa nāvi vai dažādus smagus iedzimtus defektus. Sievietēm, kuras domā par grūtniecību, jāpārbauda, vai viņām ir imunitāte pret masaliņām, ko var noteikt ar asins analīzēm. Ja viņiem nav imūna, viņām jāsaņem vakcīna pirms grūtniecības iestāšanās, un pēc tam jāgaida vismaz trīs mēneši, pirms mēģināt ieņemt. Saslimšana ar masaliņām imunitātes trūkuma dēļ grūtniecības laikā apdraud arī augļa dzīvību un drošību.
Citos gadījumos imunizācija pret masaliņām nav droša lietošanai, un tajos ietilpst:
Vidēji smaga vai smaga slimība vakcinācijas dienā
Spēcīga reakcija/alerģija pret MMR pagātnē
Asins pagatavojumu ar antivielām saņemšana pēdējā gadā
Imūndeficīts
Trombocitopēnija
Alerģija pret kādu no materiāliem (piemēram, lateksu) šāvienā.
Ja pacientiem nav stāvokļa, kas kontrindicētu masaliņu imunizāciju, ārsti viņiem iesaka to veikt. Parasti masaliņas nav letāls stāvoklis, ja vien to nav saslimusi grūtniece vai kāds ar pazeminātu imunitāti. Masalas var būt letālas, un cūciņš var izraisīt vīriešu sterilitāti. Visbiežākās MMR blakusparādības ir vairākas dienas ilgas sāpes, drudzis, izsitumi un locītavu sāpes. Ilgstošas locītavu sāpes rodas aptuveni 0-3% bērnu un aptuveni 10-25% pieaugušo sieviešu. Ir ziņots par vēl dažām MMR nelabvēlīgām sekām, taču tās mēdz rasties procentpunkta simtdaļu vai tūkstošdaļu līmenī.