Sertralīns ir ļoti efektīvs līdzeklis depresijas ārstēšanai, un depresijas ārstēšana ir zāļu galvenā funkcija. Pētījumi liecina, ka sertralīns ir efektīvāks par citiem konkurējošiem antidepresantiem depresijas ārstēšanā un ka lielākajai daļai pacientu ir pozitīva reakcija uz šīm zālēm. Vairāk nekā puse pacientu, kuri lieto sertralīnu depresijas ārstēšanai, sasniedz pilnīgu remisiju, kas nozīmē, ka depresija vairs nav problēma, bet tā joprojām var atgriezties nākotnē. Vispārīgi runājot, sertralīns ir izplatīts pirmās izvēles medikaments pacientiem, kuri cieš no depresijas tā efektivitātes un salīdzinoši zemā blakusparādību skaita dēļ. Tomēr pacienti, kas cieš no depresijas un Alcheimera slimības, var nebūt piemēroti ārstēšanai ar sertralīnu.
Antidepresanti ir īpaši izstrādāti, lai palīdzētu pacientiem, kuri cieš no depresijas. Visizplatītākie antidepresantu veidi ir selektīvie serotonīna atpakaļsaistes inhibitori (SSAI). Šīs zāles darbojas, izlīdzinot serotonīna līmeni smadzenēs, īpaši neļaujot nervam, kas atbrīvo ķīmisko vielu, to atkal uzņemt. Neirotransmiteri, piemēram, serotonīns, būtībā ir ķīmiskie vēstneši, un tiek uzskatīts, ka to līmenis smadzenēs ir saistīts ar garastāvokli. Sertralīna lietošana depresijas ārstēšanai darbojas, jo tā padara pieejamu vairāk serotonīna, lai stimulētu citus smadzeņu nervus un tādējādi izlīdzinātu pacienta garastāvokli.
Pētījumi, kas veikti par sertralīna lietošanas ietekmi depresijas ārstēšanai, parasti liecina, ka tas darbojas labāk nekā placebo vai citi plaši izplatīti antidepresanti. Galvenā ievērojamā atšķirība starp sertralīnu un citiem SSAI ir tā, ka sertralīnam ir neliela ietekme uz dopamīna, cita neirotransmitera, kā arī serotonīna līmeni. Pētījumi ir parādījuši, ka citas SSAI zāles, piemēram, fluoksetīns, ir mazāk efektīvas nekā sertralīns, ārstējot pacientus ar depresiju, un tādēļ zāles ir jāparaksta visiem pacientiem, pirms tiek izmēģinātas citas ārstēšanas metodes. Lielākajai daļai pacientu, kuri lieto šīs zāles, divu mēnešu laikā tiks sasniegta pilnīga remisija, un aptuveni 70 procentiem būs ievērojams garastāvokļa uzlabojums.
Galvenais apstāklis, kurā sertralīna lietošana depresijas ārstēšanai netiek uzskatīta par labāko ārstēšanu, ir tad, ja pacients cieš arī no Alcheimera slimības. Pētījumi liecina, ka pacientiem ar šo stāvokli zāles nav efektīvākas par placebo. Turklāt sertralīna terapijas laikā blakusparādības ir biežākas nekā placebo.
Kopumā blakusparādības radīsies aptuveni ceturtdaļai pacientu, kuri lieto sertralīnu depresijas ārstēšanai. Lielākā daļa no šīm blakusparādībām būs nelielas un ļoti viegli pārvaldāmas, taču dažkārt var rasties nopietnas blakusparādības, piemēram, neregulāra sirdsdarbība un alerģiskas reakcijas. Biežas sertralīna blakusparādības ir bezmiegs, reibonis un apetītes zudums. Sertralīna ievadīšana jauniem pacientiem var palielināt pašnāvnieciskas domāšanas un uzvedības iespējamību. Visas nopietnas sertralīna blakusparādības jāapspriež ar ārstu.