Mikrobioloģijas doktors apņemas nopelnīt, un studentiem būs jāizdara izvēle par to, ko viņi galu galā vēlētos darīt ar šo doktora grādu. Dažām mikrobioloģijas programmām ir īpašs uzsvars, piemēram, vēža pētniecība, vai arī tās piedāvā divus grādus tādās jomās kā mikrobioloģija un imunoloģija. Pretendentiem būs jāizpēta vairākas programmas, lai atrastu tās, kas ir cieši saistītas ar viņu interesēm, vai arī viņiem būs jāmeklē labas vispārizglītojošās skolas, kas pieļauj elastību un izpēti daudzās jomās. Šī nav vienīgā prasība, un skolēniem ir jāatbilst daudzām citām skolas prasībām, pirms viņi tiek uzņemti skolā.
Nodaļas, kas piedāvā mikrobioloģijas doktora grādu, precīzi norāda, ko viņi pieprasa studentu pretendentiem. Daudzās programmās tiek pieņemti studenti tikai ar bakalaura grādu. Šim grādam parasti ir jābūt līdzīgam, un visbiežāk pieņemtie grādi varētu būt bioloģijas, bioķīmijas, mikrobioloģijas vai sākotnējās medicīnas specialitātes. Dažas koledžas reti uzņem tos, kam ir tikai bakalaura grāds, un tā vietā meklē studentus ar maģistra grādu īpaši mikrobioloģijā vai tādās jomās kā ģenētika, imunoloģija vai sabiedrības veselība. Dažas no prestižākajām skolām nepieņems pretendentus, ja vien viņiem nav augstskolas līmeņa un vairāku gadu darba pieredzes.
Ir papildu pieteikuma prasības. Daudzas universitātes pieprasa studentiem kārtot vispārējo un priekšmetu absolventu ierakstu eksāmenu (GRE). Spēcīgas atzīmes, īpaši zinātnēs, var tikt augstu novērtētas. Studentiem ir nepieciešamas arī akadēmiskās vai profesionālās ieteikuma vēstules, kas apliecina viņu piemērotību doktorantūras darbam. Ārzemēs dzimušiem studentiem, iespējams, būs jākārto testi, lai pierādītu valodas brīvību.
Studenti, kuri ir veikuši labus pētījumus un atraduši skolas, kas visvairāk atbilst prasībām, visticamāk, nonāks ceļā, lai iegūtu mikrobioloģijas doktora grādu. Tāpat kā jebkurā doktorantūras programmā, studenti apmeklē nodarbības un arī pavada labu laiku, strādājot laboratorijās. Daudzas skolas vēlas, lai viņu absolventi mācītu vai strādātu par skolotāja palīgu gadu vai ilgāk, un tas patiesībā ir ieguvums daudziem studentiem, jo viņiem bieži tiek maksāta stipendija, kas var palīdzēt samazināt koledžas izmaksas.
Otrajā vai trešajā skolas gadā lielākā daļa koledžu, kas piedāvā mikrobioloģijas doktora grādu, lūdz studentiem veikt visaptverošu eksāmenu. Tas ir paredzēts, lai dažiem studentiem būtu atbilstošas zināšanas, lai turpinātu darbu šajā jomā. Dažas skolas ļaus skolēniem atkārtoti kārtot eksāmenu, ja viņi to neiztur. Kad šis eksāmens ir sekmīgi nokārtots, studenti tiek virzīti uz doktora grādu un sāk strādāt pie disertācijas, kas ir ilgstošs projekts, kas ietver oriģinālus pētījumus, kas tiek prezentēti mācībspēkiem. Fakultātei šis disertācija jāapstiprina pirms doktora grāda piešķiršanas.
Kopumā lielākā daļa studentu pavada apmēram četrus līdz piecus gadus, lai iegūtu mikrobioloģijas doktora grādu. Laiks var tikt pagarināts, ja disertācija ir ļoti sarežģīta vai fakultātes pārskatīšanas padome to sākotnēji nepieņem. Daudzu cilvēku šī grāda iegūšana ir tā vērta, lai pēc tam turpinātu karjeru privātā pētniecībā, mācībspēkos universitātē vai daudzās citās jomās.