Pareizas neauglības ārstēšanas metodes izvēle ir atkarīga no vairākiem faktoriem, tostarp no pacienta neauglības cēloņa. Piemēram, labākā ārstēšana cilvēkam, kurš ir neauglīgs nepietiekama hormonu līmeņa dēļ, var atšķirties no pareizās ārstēšanas kursa kādam, kam ir reproduktīvās anomālijas. Tāpat arī vecumam, vispārējai veselībai, vēlmēm kļūt par vecākiem un dzimumam ir svarīga loma pareizo ārstēšanas iespēju izvēlē.
Pirmais solis labākās neauglības ārstēšanas izvēlē ir fiziska pārbaude. Fiziskā pārbaude, ko veic kvalificēts medicīnas speciālists, var atklāt pamatnosacījumus, kas var izraisīt vai pasliktināt neauglību. Piemēram, STS vai vairogdziedzera problēma var traucēt ieņemšanu. Turklāt mērķtiecīga auglības pārbaude var palīdzēt precīzi noteikt problēmas ar indivīda vai pāra reproduktīvo veselību.
Kad fiziskā pārbaude un neauglības pārbaude ir pabeigta, ārsts parasti apspriež visas atklātās problēmas un neauglības ārstēšanas iespējas ar pacientu vai pāri. Tas var uzreiz atklāt labāko ārstēšanas veidu. Piemēram, ja problēma ir zems spermatozoīdu skaits, ārsts var ieteikt infekciju ārstēšanu, hormonu nomaiņu vai pat operāciju, lai palielinātu veiksmīgas grūtniecības izredzes. Ja ārstēšanas iespējas pārim nepatīk vai, visticamāk, nedarbosies, mākslīgā apsēklošana var izrādīties labāks risinājums. Dažos gadījumos neauglības cēloņi joprojām ir nenotverami, un ir nepieciešama turpmāka pārbaude.
Dažreiz labākā neauglības ārstēšana ir acīmredzama, jo pacients vēlas izvairīties no operācijas. Piemēram, ja ir nepieciešama operācija, lai atbloķētu olvadus, sieviete var vēlēties izvēlēties in vitro apaugļošanu ar donoru olšūnām, lai izvairītos no operācijas. No otras puses, pāris var vēlēties bērnu, kas ir bioloģiski saistīts ar māti. Šādā gadījumā labākā ārstēšana faktiski var būt operācija vai līdzīga procedūra, ko var izmantot, lai atbrīvotu olvadus vai citas problēmas.
Bieži vien vecumam ir svarīga loma labākās neauglības ārstēšanas izvēlē. Piemēram, vecāka gadagājuma indivīds vai pāris var uzskatīt par nepieciešamu veikt pēc iespējas agresīvāko ārstēšanas veidu. Tas ir tāpēc, ka sievietes auglībai ir tendence samazināties līdz ar vecumu, tāpēc vecāka sieviete vai pāris var izjust lielāku spiedienu, lai uzreiz gūtu panākumus. Jaunāka sieviete vai pāris var uztvert vairāk laika, lai mēģinātu, izvēloties mazāk invazīvu, vieglāku ārstēšanu, vismaz sākumā.
Izmaksas ir vēl viens svarīgs apsvērums, izvēloties pareizo neauglības ārstēšanu. Dažu auglības ārstēšanas veidu pabeigšana var maksāt tūkstošiem dolāru. Turklāt dažiem ir zems panākumu procents pirmajā vai pat otrajā mēģinājumā. Tādējādi indivīds vai pāris vismaz daļu šī lēmuma var balstīt uz cenu pieejamību.