Atšķirības starp datortomogrāfijas (CT) skenēšanu un rentgenstaru ir daudz un dažādas, sākot no izveidotā attēla kvalitātes līdz nepieciešamajam telpas daudzumam aprīkojuma izvietošanai. Radiācijas iedarbības līmeņi un kopējās aprīkojuma izmaksas arī ir būtiskas atšķirības starp CT skenēšanu un rentgenstaru.
CT skenēšana un rentgena starojums ļoti atšķiras atkarībā no iegūtā attēla kvalitātes. Kā rentgena tehnoloģijas paplašinājums, CT skenēšana uzņem vairākus rentgena attēlus ap skenējamās ķermeņa zonas apkārtmēru. Šis paņēmiens nodrošina skaidru trīsdimensiju attēlu no CT skenēšanas, salīdzinot ar bieži izplūdušu attēlu plakanā divdimensiju skatā, ko rada rentgena starojums. Papildus skaidrākai attēlveidošanai, izmantojot CT skenēšanu, var iegūt arī precīzākus noteiktu zonu vai orgānu attēlus, nekā var redzēt ar rentgena staru.
Radiācijas iedarbības līmenis uz pacientu ir galvenais apsvērums, kad ārsts izlemj starp CT skenēšanas nepieciešamību un rentgenstaru. CT skenēšana izmanto daudz lielāku starojuma daudzumu nekā rentgena starojums, galvenokārt tāpēc, ka CT skenēšana ir rentgenstaru sērija, nevis viens attēls. Paaugstināts starojums var pakļaut pacientu augstāka riska kategorijā attiecībā uz šūnu bojājumiem, ja iedarbība ir pārmērīga. Šī iemesla dēļ daudzi ārsti var izvēlēties veikt CT skenēšanu tikai tad, ja tas ir absolūti nepieciešams pareizas diagnozes noteikšanai.
Iekārtas izmērs starp CT skenēšanu un rentgena iekārtu ir vēl viena ievērojama atšķirība starp diviem attēlveidošanas iekārtu veidiem. Rentgena aparāti ir salīdzinoši mazi un bieži vien vieglāk lietojami nekā kontrastējošā CT skenēšanas iekārta, kas ir liela un sarežģīta ekspluatācijā. Parasti pacientam ir jāguļ vai jāstāv rentgena negatīva priekšā, lai iegūtu attēlu. CT tehnoloģija paredz, ka pacientam jāieiet lielā cilindriskā gredzenā, kas griežas ap ķermeni, veidojot attēlu. Radiogrāfa izmantotā tehnoloģija ir arī prasīgāka CT skenēšanai nekā rentgena stariem.
DT skenēšanas lieluma un tehnoloģiskā progresa dēļ izmaksas, kas saistītas ar iegādi, ekspluatāciju un mājokli, ir daudz augstākas nekā rentgena iekārtas iegādei. CT skenēšana un rentgens ir divas iekārtas, kas parasti tiek novērotas lielākajā daļā slimnīcu vai attēlveidošanas iestāžu, pat ja CT skenēšanas izmaksas ir lielākas. Abas tehnoloģijas var būt būtiski diagnostikas instrumenti medicīnas speciālistiem. Jebkuras bažas par nepieciešamību starp CT skenēšanu un rentgenstaru jārisina ārstam.