Vairākas desmitgades hormonu aizstājterapija (HAT) tika uzskatīta par zelta standarta ārstēšanu sievietēm menopauzes periodā, lai samazinātu simptomus, piemēram, karstuma viļņus, garastāvokļa traucējumus, maksts sausumu un citus. Estrogēna un progestīna kombinācija tika izmantota bieži un tika uzskatīta par drošu sievietēm. Kopš 2002. gada šīs ārstēšanas drošums ir vairākkārt apšaubīts, jo statistiski nozīmīgi pētījumi liecina, ka HAT ir daudz riska faktoru. Tostarp hormonu aizstājterapija un krūts vēža risks bieži iet roku rokā, un daudzi ārsti tagad uzskata HAT par pēdējo līdzekli, nevis par pirmo izvēli.
Turpmākie pētījumi ir apstiprinājuši, ka hormonu aizstājterapija un krūts vēzis ir saistīti. Jo īpaši ir pierādījumi, ka HAT var palielināt audzējus, bet padarīt tos mazāk pamanāmus mammogrammas rezultātos. Tas nozīmē, ka sievietēm krūts vēzis biežāk tiek diagnosticēts vēlākās slimības stadijās, kad pilnīgas remisijas vai izārstēšanas iespējamība nav tik augsta. Tiek uzskatīts, ka HAT estrogēni arī tieši veicina vēža augšanu aptuveni 66% audzēju, jo šie vēža veidi satur estrogēnu receptorus. Estrogēna ievadīšana baro audzēju un var palielināt tā izmēru un stiprumu.
Papildu pētījumi 2010. gadā liecina, ka saikne starp hormonu aizstājterapiju un krūts vēzi nostiprinās līdz ar lietošanas ilgumu. Ilgstoši HAT lietotāji, kuri ir definēti kā HAT lietojuši piecus gadus vai ilgāk, ir lielāka iespēja saslimt ar krūts vēzi un attīstīt agresīvākus slimības veidus, kas palielina mirstību. Tas liecina, ka, ja HAT vispār tiks lietots, plānotajam lietošanas ilgumam jābūt ļoti īsam. Agrāk daudzas sievietes izmantoja šo ārstēšanu desmit gadus vai ilgāk, tādējādi ievērojami palielinot agrīnas mirstības risku krūts vēža vai citu vēža veidu dēļ.
Vairākos pētījumos apkopotie pierādījumi norāda uz skaidru korelāciju starp hormonu aizstājterapiju un krūts vēzi, taču HAT joprojām ir pieejama lielākajā daļā jomu. Piemēram, ASV hormonu terapiju var izmantot pēc pilnīgas histerektomijas vai arī to var ieteikt smagas osteoporozes gadījumā. Tā pastāvīgā pieejamība ļauj to izmantot ārpus marķējuma, tradicionālākā veidā menopauzes simptomu novēršanai, un ārsti joprojām var izrakstīt vai ieteikt to pacientiem. Iespējams, tā lietošana ir pamatota, taču pacientiem pirms tā lietošanas ir pilnībā jāapsver tā potenciāls radīt dzīvībai bīstamas blakusparādības.
Ir arī daži jautājumi par hormonālās dzimstības kontroles drošību, kurā tiek izmantoti tie paši hormoni. Līdz šim ir jūtams neliels krūts vēža riska pieaugums, kas ilgst aptuveni 10 gadus pēc pēdējās lietošanas reizes, bet pēc tam normalizējas sievietēm, kuras nav lietojušas hormonālo dzimstības kontroli. Joprojām nav zināms, vai hormonālajai dzimstības kontrolei un pēc tam HAT var būt kumulatīvs efekts, kas palielina krūts vēža risku. Iespējams, normālu hormonu palielināšana gados, kad sievietes tos ražo, ir mazāk bīstama nekā to pievienošana pēc šo hormonu ražošanas samazināšanās.