Lielākā daļa benzokaīna blakusparādību ir salīdzinoši vieglas un ietver ādas kairinājumu lietošanas vietā. Dažiem cilvēkiem, kuri lieto šīs zāles, var rasties galvassāpes, pastiprināta svīšana vai trauksme. Nopietnākas blakusparādības, par kurām jāziņo ārstam turpmākai novērtēšanai, ir reibonis, ādas krāsas izmaiņas vai infekcija. Reti var rasties potenciāli dzīvībai bīstama alerģiska reakcija, kas pazīstama kā anafilakse, izraisot tādus simptomus kā paātrināta sirdsdarbība, sejas pietūkums vai apgrūtināta elpošana. Jebkuras aizdomas par benzokaīna blakusparādībām ir jānovērtē medicīnas speciālistam, lai pārliecinātos, ka, lietojot šīs zāles, nav nopietnu komplikāciju.
Viegls apsārtums un diskomforts lietošanas vietā ir visbiežāk ziņotās benzokaīna blakusparādības un parasti izzūd dažu minūšu vai stundu laikā pēc šo zāļu lietošanas. Stipras sāpes, pastiprināts apsārtums vai tulznu veidošanās var liecināt par alerģiju, un par to jāziņo ārstam. Reizēm skartajā zonā var parādīties arī sausi ādas plankumi, kas atgādina ekzēmu. Šie simptomi parasti izzūd paši pēc zāļu lietošanas pārtraukšanas.
Ādas infekcijas vai krāsas izmaiņas ir salīdzinoši retas benzokaīna blakusparādības, taču, ja tās rodas, nepieciešama tūlītēja medicīniska palīdzība. Vietējās vai perorālās antibiotikas parasti lieto, lai novērstu jebkādas infekcijas, kas attīstās benzokaīna lietošanas rezultātā. Jebkuras ādas krāsas izmaiņas ir jānovērtē ārstam, lai pārliecinātos, ka skartajā zonā nav nopietnu komplikāciju, piemēram, samazināta asinsrite. Simptomi, piemēram, galvassāpes vai reibonis, parasti ir viegli, bet, ja šīs blakusparādības saglabājas vai pasliktinās, par to jāinformē ārsts.
Krampji, sirds ritma izmaiņas vai ārkārtēja slikta dūša ir iespējamas benzokaīna blakusparādības. Vēdera krampji, caureja vai vemšana ir medicīniski jānovērtē, īpaši, ja to pavada drudzis. Melniem vai asiņainiem izkārnījumiem vai vemšanai, kas atgādina kafijas biezumus, ir jādodas uz tuvāko slimnīcu, lai izslēgtu smagu kuņģa-zarnu trakta bojājumu.
Anafilakse ir viena no visbīstamākajām iespējamām benzokaīna blakusparādībām un var izraisīt nāvi dažu minūšu laikā bez neatliekamās medicīniskās palīdzības. Sāpes krūtīs, apgrūtināta elpošana un samaņas zudums pat tikai uz dažām sekundēm ir potenciālas anafilakses pazīmes. Sejas pietūkums, īpaši mēles vai rīkles pietūkums, var izraisīt neatgriezeniskus smadzeņu un citu ķermeņa orgānu bojājumus skābekļa trūkuma dēļ asinsritē.