Prezervatīvu efektivitāti ietekmē vairāki faktori, jo īpaši tas, kā tiek nēsāts un lietots gan vīriešu, gan sieviešu prezervatīvs. Prezervatīvu vecums un stāvoklis var arī ierobežot tā spēju novērst seksuāli transmisīvās slimības (STS) un grūtniecību. Šie faktori var ievērojami palielināt neparedzētas grūtniecības iespējamību.
Pētījumos atklāts, ka daudzi vīrieši neuzvelk prezervatīvu vai nevalkā to pareizi. Pārāk rupji vai ar iekšpusi uzvelkot vīriešu prezervatīvu, tas var saplīst vai vājināt, tādējādi samazinot prezervatīvu efektivitāti. Pārāk maza vai pārāk liela prezervatīvu izmantošana var arī ierobežot tā spēju novērst grūtniecību un STS. Prezervatīvs, kas ir pārāk cieši pievilkts vai uzvilkts, ja tā galā nav pietiekami daudz vietas, var palielināties plīsuma vai salūzuma risks; pārāk liels prezervatīvs, visticamāk, nokrist vai izlīs. Šī iemesla dēļ vīriešiem vajadzētu iegādāties un lietot atbilstoša izmēra prezervatīvus un lietot tos tieši tā, kā norādīts uz iepakojuma.
Sieviešu prezervatīviem var būt līdzīgas problēmas. Lietojot nepareizi pieguļošu sieviešu prezervatīvu, tas var izkustēties dzimumakta laikā, palielinot grūtniecības iespējamību un iespēju iegūt STS. Sieviešu prezervatīvi parasti tiek uzskatīti par mazāk efektīviem nekā vīriešu prezervatīvi par 5 līdz 10 procentiem.
Iespējams, viens no lielākajiem faktoriem, kas ietekmē prezervatīvu efektivitāti, ir preces lietošanas laiks. Lai šāda veida dzimstības kontrole nodrošinātu optimālu aizsardzību, tā ir jāvalkā pirms jebkādas iespiešanās un visas darbības laikā. Prezervatīvu uzlikšana pēc jau uzsākta dzimumakta var ievērojami palielināt STS pārnešanas vai saslimšanas risku un grūtniecības iespējamību.
Gan vīriešu, gan sieviešu šķirņu gadījumā prezervatīvu efektivitāti lielā mērā nosaka prezervatīvu kvalitāte. Katram prezervatīvam ir derīguma termiņš, kas uzdrukāts uz katra prezervatīvu kastītes un iepakojuma. Lietojot vecu prezervatīvu, var palielināties iespējamība, ka tas saplīsīs vai veidos asaras vai caurumus. Datuma pārbaude uz iepakojuma pirms katras lietošanas reizes var palīdzēt novērst šo problēmu.
Pat pirms prezervatīvu derīguma termiņš ir beidzies, tas var tikt bojāts. Prezervatīvi jāglabā vēsā, sausā vietā iepakojuma iekšpusē līdz pat lietošanas brīdim. Turot to makā, makā vai automašīnā, tas var tikt pakļauts augstam siltuma līmenim un iespējamiem citu priekšmetu bojājumiem, tādējādi samazinot prezervatīvu efektivitāti. Prezervatīvus nekad nedrīkst pakļaut tiešiem saules stariem vai turēt siltuma avotu tuvumā, jo tie var sabojāt to integritāti.
Prezervatīvs ir jāpārbauda pirms lietošanas, un to drīkst lietot tikai vienu reizi. Ja prezervatīvs ir dzeltens, saplaisājis vai sauss, to nedrīkst lietot. Pētījumos atklāts, ka, nevainojami lietojot vīriešu prezervatīvu, divas no 100 sievietēm iestājas grūtniecība. Ja to lieto nepareizi, šis skaitlis palielinās līdz katrām 15 no 100 sievietēm. Sieviešu prezervatīvs, ja to lieto pareizi, piecās no 100 sievietēm iestājas grūtniecība; ja to lieto nepareizi, grūtniecība iestājas 21 no 100 sievietēm.