Malabsorbcijas simptomi rodas, ja ķermeņa kuņģa-zarnu trakta sistēma nedarbojas normāli un nespēj absorbēt un izmantot uzturvielas, ko tā saņem ar pārtiku. Tas atšķiras no scenārijiem, kad cilvēki nepatērē pietiekami daudz uztura pārtikas, bet vairumā gadījumu tie, kuriem ir malabsorbcija, ēd atbilstošu diētu. Slikta uzsūkšanās, ko var izraisīt daudzi apstākļi, nozīmē, ka organisms nepareizi izmanto pārtiku, ko tas saņem. Nelieli simptomi, piemēram, dažu dienu slikta caureja un vājums, var pavadīt īslaicīgu malabsorbcijas gadījumu. Alternatīvi simptomi var kļūt ļoti nopietni, ja stāvoklis ir hronisks, un gandrīz visas ķermeņa sistēmas cieš no būtisku uzturvielu un vitamīnu trūkuma.
Viens no redzamākajiem malabsorbcijas simptomiem ir izkārnījumu izskata izmaiņas, un tas bieži vien ir pirmais problēmu rādītājs. Dažiem cilvēkiem ir bieža ūdeņaina caureja, bet citiem ir norādes par pārmērīgu tauku daudzumu izkārnījumos, kas pēc izskata kļūst gaiši un var pielipt pie tualetes poda vai mēdz peldēt ūdens virspusē. Ļoti apjomīgi izkārnījumi, kad tiek patērēts normāls pārtikas daudzums, var arī liecināt par to, ka ķermenis izšķērdējas, nevis izmanto saņemto uzturu. Izkārnījumu izmaiņas bieži pavada citi zarnu simptomi, piemēram, krampji vēderā, gāzes un grēmas.
Daudziem cilvēkiem, kuriem ir īslaicīgi kuņģa darbības traucējumi kuņģa gripas vai vieglas pārtikas izraisītas slimības dēļ, dažas dienas var rasties malabsorbcijas simptomi. Ja stāvoklis kļūst hronisks, šiem agrīnajiem simptomiem ir tendence pasliktināties un kļūst acīmredzamas citas sliktas uztura uzsūkšanās pazīmes. Tie, kuriem ir hroniska malabsorbcija, var pamanīt tādas lietas kā neizskaidrojams svara zudums. Bērniem var būt aizkavēta izaugsme vai viņiem tiek diagnosticēta nespēja attīstīties.
Konkrētāki malabsorbcijas simptomi var būt atkarīgi no problēmas cēloņa un neuzsūktajām uzturvielām. Daži iemesli nozīmē, ka kuņģa-zarnu trakta sistēma nespēj absorbēt dažas uzturvielas, bet slieksnis absorbē citas. Ja šāda veida malabsorbcija ir hroniska, visvairāk var tikt ietekmētas dažādas ķermeņa daļas, kas ir atkarīgas no konkrētām uzturvielām. Kalcija deficīts var ietekmēt kaulu augšanu, blīvumu un izturību; zems olbaltumvielu līmenis izraisa ūdens aizturi, un dzelzs, folijskābes vai B12 vitamīna trūkums var izraisīt dažādas anēmijas formas, kas izraisa vājuma vai noguruma sajūtu.
Daudzos gadījumos malabsorbcijas simptomi liecina par vairāku barības vielu deficītu. Anēmija, kaulu vājums un ūdens aizture var būt kopā. Ja šos simptomus turpina ignorēt, var uzkrāties vairāku ķermeņa sistēmu bojājumi. Sliktākos gadījumos tiem, kam hroniski trūkst barības vielu, var rasties nieru darbības traucējumi vai pat sirds mazspēja. Ir svarīgi diagnosticēt cēloni un, ja iespējams, to ārstēt. Tajā pašā laikā tiem, kurus skārusi malabsorbcija, ir nepieciešami citi uztura atbalsta līdzekļi, lai kompensētu trūkstošās uzturvielas.