Septiskās sistēmas tiek izmantotas vietās, kur nav pieejama sadzīves ūdens atkritumu apsaimniekošana. Tā kā septiskās tvertnes ir ļoti svarīgas veselīgai mājsaimniecībai, septisko tvertņu apstrāde ir būtiska. Ir vairāki septisko tvertņu apstrādes veidi, taču visefektīvākā var būt regulāra sūknēšana, ko veic kvalificēti septisko tvertņu pakalpojumi. Alternatīvas ārstēšanas metodes ietver bioloģiskas piedevas, kas paredzētas “labo baktēriju” pievienošanai septiskajai sistēmai.
Lai pareizi apstrādātu septisko tvertni, ir jāzina, kā notiek process, kur atrodas pārbaudes portāls un kāds ir izmantotās augsnes stāvoklis. Septiskās sistēmas sastāv no septiskās tvertnes un notekas laukiem. Izmestais ūdens no tualetēm, ko sauc par melno ūdeni, un izlietnēm, dušām, veļas mašīnām, ko sauc par pelēko ūdeni, ieplūst septiskajā tvertnē. Cietie atkritumi nogrimst tvertnes apakšā, radot dūņas, savukārt šķidrie atkritumi izplūst notekas laukos. Drenāžas lauki ir vairākas pazemes tranšejas, kas izklātas ar granti, kas organiski apstrādā atkritumus. Noderīgie mikroorganismi augsnē noārda baktērijas, vīrusus un citus patogēnus, atkritumiem sūcot uz augšu. Septiskās sistēmas apstrāde nozīmē, ka šis atkritumu apstrādes process darbojas pareizi.
Pareiza apkope bieži ir labākā septisko tvertņu apstrāde. Lai noteiktu septiskās tvertnes izsūknēšanas grafiku, parasti ir nepieciešama regulāra gan septiskās tvertnes, gan drenāžas lauku pārbaude. Šis grafiks ir atkarīgs no septiskās tvertnes lieluma, iedzīvotāju skaita mājā, ūdens patēriņa daudzuma dienā un cieto vielu daudzuma notekūdeņos. Septiskā sistēma būs jāiztukšo biežāk, jo arvien vairāk cilvēku katru dienu izmet vairāk cietvielu un patērē vairāk ūdens, it īpaši, ja tvertne ir maza.
Profilakse var būt svarīga septisko tvertņu apstrādes sastāvdaļa. Daži profilakses paņēmieni ietver atkritumu izvešanas ierobežošanu, lai samazinātu cieto daļiņu daudzumu, ūdens patēriņa samazināšanu līdz minimumam un ūdens patēriņa sadalīšanu vairākās dienās, tā vietā, lai vienu dienu būtu liels daudzums, bet nākamajā vairs ne. Citas metodes var ietvert ūdeni taupošu ierīču un augstas efektivitātes tualetes izmantošanu, noplūžu novēršanu un ūdens taupīšanu, ātri mazgājoties. Daži māju īpašnieki izlietņu un tualetes podu tīrīšanai izmanto cepamo sodu vai maigus mazgāšanas līdzekļus, jo komerciālie tīrīšanas līdzekļi var iznīcināt labvēlīgās baktērijas, kas faktiski palīdz uzturēt septisko sistēmu. Tāpat ir ieteicams nekad nebraukt vai novietot automašīnu uz septiskās tvertnes vai notekas laukiem.
Daudzi septisko tvertņu apstrādes uzņēmumi apgalvo, ka septiskās sistēmas piedevas izšķīdinās septikā esošās cietās vielas un padarīs sūknēšanu nevajadzīgu, taču daudzi vides eksperti piekrīt, ka septiskās tvertnes izsūknēšana ir nepieciešama. Parasti ir ieteicamas ikgadējas pārbaudes un sūknēšana ik pēc trīs līdz pieciem gadiem.