Atsevišķas STS vai seksuāli transmisīvo slimību ārstēšanas metodes neatkarīgi no tā, vai tās ietver medikamentus vai terapiju, ir atkarīgas no inficēto STS veida. STS ārstēšanai parasti ir nepieciešami recepšu medikamenti. Lai gan dažos gadījumos pacientam var būt tikai viena zāļu deva, citām STS nepieciešama mūža ārstēšana.
Antibiotikas ir izplatītas STS ārstēšanas metodes bakteriālu infekciju ārstēšanai. Hlamīdiju, STS, ko izraisa baktērijas Chlamydia trachomatis, bieži var ārstēt ar vienu vai vairāku devu antibiotiku terapiju tablešu veidā. Cita STS, gonoreja, bieži tiek inficēta vienlaikus ar hlamīdiju. To arī ārstē ar antibiotikām. Pacientiem ar smagiem šo slimību gadījumiem var tikt veikta intensīva ārstēšana, un pacienti var sagaidīt, ka viņi atgriezīsies pēcpārbaudes vizītē, lai noteiktu, vai ārstēšana bija efektīva.
Sifilisu, citu bakteriālu infekciju, parasti var ārstēt ar parastu antibiotiku, piemēram, penicilīnu. Pacientiem zāles parasti netiek ievadītas iekšķīgi, jo ir pierādīts, ka tās nav efektīvas sifilisa ārstēšanā. Tā vietā antibiotika parasti tiek ievadīta intravenozi vai injekcijas veidā.
Infekcijas ādas slimības, kas iegūtas seksuāla kontakta ceļā, piemēram, kaunuma utis vai kašķis, parasti tiek ārstētas ar kāda veida lokāliem pesticīdiem, līdzīgi kā ārstē galvas utis. Losjons, krēms vai cits lokāls līdzeklis ir visizplatītākā metode šāda veida STS izskaušanai. Tomēr dažām ādas slimībām var būt nepieciešamas arī perorālas zāles. Tāpat kā ar citām STS ārstēšanas metodēm, arī pacienta seksuālajiem partneriem ir ieteicams meklēt un ārstēties, kad tiek ārstēta ādas slimība.
STS, kas izraisa ādas izciļņus, piemēram, molluscum contagiosum, var ārstēt dažādos veidos. Daži ārsti var dot priekšroku izciļņiem iztukšot, savukārt citi izvēlas tos noņemt, izmantojot lāzerus vai saldēšanas līdzekļus. Krēmi un citi lokāli lietojami medikamenti var arī atbrīvot pacientus no vīrusa. Tomēr vairumā gadījumu molluscum contagiosum dažu mēnešu laikā var izzust atsevišķi. Dzimumorgānu kondilomu ārstēšanai bieži izmanto arī lokālus krēmus vai želejas un saldēšanas līdzekļus.
Dažas STS ārstēšanas metodes nevar izārstēt attiecīgās slimības. Tādus vīrusus kā HIV, AIDS un dzimumorgānu herpes nevar izārstēt. Lai gan to simptomus var ārstēt ar dažādiem perorāliem medikamentiem vai lokāliem līdzekļiem, cilvēki, kuri saslimst ar šīm slimībām, var sagaidīt, ka viņi saņems STS ārstēšanu uz mūžu. AIDS un HIV ārstēšana tiek uzskatīta par sarežģītu un ir atkarīga no katra atsevišķa pacienta gadījuma. Parasti šo STS simptomu ārstēšanai ir nepieciešama vairāku zāļu kombinācija, piemēram, pretretrovīrusu zāles.