Vairākus dažādus faktorus var uzskatīt par trauksmes traucējumu cēloņiem. Trauksmes traucējumu pamatcēloņu identificēšana var palīdzēt ārstiem un terapeitiem noteikt pacientiem piemērotas ārstēšanas metodes un palīdzēt viņiem samazināt simptomus. Visbiežāk sastopamie trauksmes traucējumu cēloņi ir ģenētika, smadzeņu ķīmijas izmaiņas vai novirzes, personības anomālijas vai traucējumi un dzīves apstākļi.
Ārsti uzskata, ka dažiem cilvēkiem ir lielāka iespēja attīstīties trauksmes traucējumiem, ja viņu ģimenē ir bijušas trauksmes problēmas. Nav zināms, kāda ir precīza trauksmes traucējumu ģenētiskā saikne, un nav iespējams pateikt, vai persona, kuras ģimenes anamnēzē ir bijuši šie traucējumi, attīstīsies. Dažiem cilvēkiem trauksmes traucējumi attīstās ļoti agrīnā dzīves posmā, savukārt citi simptomi sāk izjust tikai pilngadību. Cilvēkiem, kuru ģimenes anamnēzē ir bijuši trauksmes traucējumi, jo īpaši viņu tuvākajās ģimenēs, vajadzētu pievērst īpašu uzmanību savam garīgajam stāvoklim un konsultēties ar saviem ārstiem vai garīgās veselības speciālistiem, ja viņiem rodas simptomi, kas liecina par trauksmes traucējumiem vai problēmām, piemēram, pastāvīga uztraukšanās, miega traucējumi, aizkaitināmība, koncentrēšanās grūtības, pastāvīgs muskuļu sasprindzinājums un kuņģa-zarnu trakta problēmas bez cita iemesla.
Tiek uzskatīts, ka smadzeņu ķīmijas izmaiņas vai novirzes ir viens no lielākajiem trauksmes traucējumu cēloņiem. Ārsti nezina precīzas izmaiņas smadzeņu ķīmijā, kas izraisa pastāvīgu nemiera sajūtu un trauksmes lēkmes, taču daudzi pacienti, kuriem diagnosticēti šie traucējumi, labi reaģē uz zālēm, kas maina noteiktu ķīmisko vielu līmeni smadzenēs. Visbiežāk lietotās zāles trauksmes traucējumu ārstēšanai ir antidepresanti un benzodiazepīni, kas maina neirotransmiteru līmeni smadzenēs.
Cilvēkiem, kuriem diagnosticēti personības traucējumi, var būt lielāka iespēja attīstīties trauksmes traucējumiem. Daži ārsti un garīgās veselības speciālisti uzskata, ka noteiktas personības iezīmes var izraisīt arī trauksmes traucējumus. Piemēram, cilvēkam ar zemu pašnovērtējumu var būt grūtības tikt galā ar stresu un citām neērtām situācijām, kas viņam palielina trauksmes problēmu attīstības iespējamību.
Noteiktu apstākļu un dzīves notikumu pārdzīvošana var veicināt trauksmes rašanos, īpaši, ja cilvēkam ir citi riska faktori. Cilvēkiem, kuri nonākuši ļoti saspringtās un sarežģītās situācijās, piemēram, kļuvuši par vardarbības ģimenē upuri, bieži vien ir grūti tikt galā ar savām jūtām un apstākļiem, kas izpaužas kā nemiers. Trauksmes traucējumus un simptomus var veicināt arī citas ārējās ietekmes, piemēram, noteiktu narkotiku lietošana vai augsta kofeīna līmeņa patērēšana.