Mikroaļģu biodegviela ir alternatīvs degvielas avots, kas iegūts no aļģēs atrodamajām eļļām un ogļhidrātiem. Biodegvielas ražošanas process no aļģēm ir pielāgots līdzīgām biodīzeļdegvielas ražošanas metodēm, izmantojot tādus procesus kā pāresterifikācija un fermentācija, lai radītu degvielu no tādiem augiem kā kukurūza un sojas pupiņas. Aļģu izmantošana biodīzeļdegvielas un jēlnaftas ražošanai bieži vien ir rentablāka, jo hidroponiski audzētās aļģes ražo vairāk eļļas nekā līdzīgi augi, kas aug augsnē.
Mikroaļģu biodegvielas ražošanas process ir diezgan vienkāršs. Aļģes audzē atklātos dīķos, slēgtās cilpas sistēmās vai fotobioreaktoros. Šīs aļģes novāc un žāvē izmantošanai mikroaļģu biodegvielas ražošanas procesā. Eļļas pēc tam ekstrahē no aļģēm un pāresterifikācijas ceļā pārvērš biodīzeļdegvielā vai jēlnaftas veidā ar zaļu krāsojumu. Atlikušo materiālu izmanto bioetanola vai biobutanola radīšanai, izmantojot fermentācijas procesu.
Aļģu audzēšanas metodes ir bijušas joma, kas rada lielas bažas biodegvielas ražotājiem. Aļģes aug ātri, salīdzinot ar citām kurināmā kultūrām, un vidējais ražas cikls ir no vienas līdz desmit dienām. Lai gan aļģes var veiksmīgi audzēt un novākt atklātos dīķos, šie dīķi ir pakļauti piesārņojumam. Slēgtās cilpas sistēmas un fotobioreaktori ir paredzēti, lai novērstu ārēja piesārņojuma iespējamību, taču tiem ir savi trūkumi, kas izpaužas kā ražas novākšanas grūtības, ekspluatācijas izmaksas un sākotnējie ieguldījumi.
Tā kā ir pieprasījums pēc vienmērīga sterila oglekļa dioksīda (CO2) piegādes, daudzas slēgtā cikla sistēmas un fotobioreaktori ir izstrādāti tā, lai tiem būtu simbiotiskas attiecības ar rūpnieciskajiem dūmu skursteņiem. Šajā dizainā aļģu audzēšanas iekārtas atkārtoti izmanto rūpnīcas CO2 emisijas, lai veicinātu aļģu augšanu biodegvielas ražošanai. Jāņem vērā, ka, lai gan mikroaļģu biodegviela tiek uzskatīta par zaļo alternatīvo degvielu, tā rada tikai neitrālu CO2 emisiju, jo audzēšanas posmā uztvertais CO2 izdalās, sadedzinot biodegvielu. Biodegvielas izmantošanas priekšrocības slēpjas faktā, ka šīs CO2 neitrālās degvielas var novērst papildu CO2 atmosfērā, ko rada CO2 pozitīvā fosilā kurināmā sadedzināšana.
Mikroaļģu biodegvielas izmantošana sniedz vairākas atšķirīgas priekšrocības nozarēm un patērētājiem. Audzējot aļģes biodegvielas ražošanai, nozares var samazināt savu ietekmi uz vidi, bieži saņemot nodokļu atvieglojumus un valdības subsīdijas, kas tiek novirzītas patērētājiem kā zemākas cenas. Dažos gadījumos nozares var izmantot un ražot mikroaļģu biodegvielu vienā un tajā pašā tuvumā, tādējādi piegādājot degvielu rūpnīcai, vienlaikus radot aļģu audzēšanas procesam nepieciešamo CO2. Biodegvielas izmantošanas priekšrocības var redzēt arī samazinātā atkarībā no fosilā kurināmā un zemākām degvielas izmaksām, īpaši aviācijas un transporta nozarēs.