Biodīzeļdegviela ir dīzeļdegvielas veids, kas ražots no organiskām sastāvdaļām, piemēram, dzīvnieku taukiem, neapstrādātām vai lietotām cepamajām eļļām un daudziem augiem. Mikroaļģu biodīzeļdegviela kā izejvielu izmanto aļģu veidu, ko dēvē par mikroaļģēm. Šim biodīzeļdegvielas veidam ir vairākas priekšrocības, piemēram, ilgtspējīga dīzeļdegvielas veida radīšana un oglekļa emisiju samazināšana. Ir arī trūkumi, piemēram, nepieciešams vairāk zemes, lai radītu aļģes, un apšaubāma efektivitāte.
Aļģes ir divu veidu: makroaļģes un mikroaļģes. Lielākā atšķirība starp šīm abām ir izmērā, jo makroaļģes mēra collās vai centimetros, savukārt mikroaļģes ir vienšūnas vai sastāv tikai no vienas šūnas. Neskatoties uz to, ka makroaļģes ir lielākas, to neizmanto biodīzeļdegvielai. Tas ir tāpēc, ka eļļas, kas veido makroaļģes, nav piemērotas biodīzeļdegvielas ražošanai; tikai mikroaļģēm ir piemērotas eļļas biodīzeļdegvielas ražošanai.
Dažas no biodīzeļdegvielas ražošanā izmantotajām kultūrām ir jatrofa, kokosrieksti un palmu eļļa. Jatropha saražo 202 galonus (764 litrus) eļļas uz akru (376 metri4), kokosrieksts dod 287 galonus (1.08 kilolitrus) uz akru, bet palmu eļļa saražo 636 galonus (2.4 kilolitrus) uz akru. Mikroaļģes saražo no 6,283 galoniem līdz 14,641 galoniem (23.7 kilolitriem līdz 55.4 kilolitriem) uz akru.
Šī augstā raža ne tikai padara mikroaļģu biodīzeļdegvielu ilgtspējīgu, bet arī nozīmē, ka būs jāaudzē mazāk augu, lai iegūtu ievērojamu biodīzeļdegvielas ražu. Arī mikroaļģes var augt gandrīz jebkur, tāpēc nav nepieciešami īpaši lauki vai platības, kurās aļģes audzēt. Mikroaļģes var arī izdalīt oglekļa emisijas, tādējādi samazinot oglekļa pēdas nospiedumu jebkurā aļģu audzēšanas vietā.
Lai gan tas padara mikroaļģu biodīzeļdegvielu pievilcīgu, pārejai uz šāda veida dīzeļdegvielu ir daži trūkumi. Lai radītu pietiekami daudz biodīzeļdegvielas patēriņam visā pasaulē, lauksaimniecības zemes būs jāpārveido, lai audzētu mikroaļģes, un būs nepieciešams vairāk lauksaimniecības zemes, lai apmierinātu pieaugošo vajadzību pēc dīzeļdegvielas. Mikroaļģes arī izdala vairāk slāpekļa oksīda nekā dīzeļdegviela uz naftas bāzes. Mikroaļģu biodīzeli kā biodīzeli nevar transportēt pa caurulēm; to var pārvadāt tikai ar kravas automašīnu vai dzelzceļu, kas palielina izmaksas.
Līdz ar to mikroaļģu biodīzeļdegviela neplūst labi zemā temperatūrā, kā arī nedarbojas labi zemā temperatūrā, jo tā sabiezē. Arī mikroaļģu biodīzeļdegvielas kopējā veiktspēja ir zemāka. Tas nozīmē, ka tiks negatīvi ietekmēta arī degvielas ekonomija, jo ir mazāka energoefektivitāte un tādējādi motora darbināšanai nepieciešams vairāk mikroaļģu biodīzeļdegvielas.