Kas ir mikromasīvs?

Mikromasīvs ir DNS, proteīna vai audu punktu secība, kas sakārtota uz masīva vieglai vienlaicīgai analīzei. Visslavenākais ir DNS mikromasīvs, kam ir neatņemama loma gēnu ekspresijas profilēšanā. Pamatnes materiāls ir stikls, plastmasa vai silīcija mikroshēma. Alternatīvi DNS mikroshēmas nosaukumi ietver gēnu mikroshēmu, DNS mikroshēmu un biočipu. Mazos DNS fragmentus sauc par zondēm.

Mikromasīvu var izgatavot dažādos veidos. Primitīvākais ir vienkārši nomest DNS uz stikla priekšmetstikliņiem, izmantojot tapas. Sarežģītākas metodes izmanto fotolitogrāfiju, elektroķīmiskas pieejas un pat tintes drukāšanu — jebko, kas var precīzi nogādāt DNS precīzā vietā.

DNS mikromasīvs ir 1980. gadu beigu un 1990. gadu sākuma produkts, kad biotehnoloģija patiešām sāka uzplaukt. Mikromasīvs ļauj pētniekam vienlaikus veikt testu secību visiem paraugiem, ievērojami paātrinot izpēti. Tradicionālie bioloģiskie eksperimenti darbojas ar lietām pa vienam. Dažkārt zondes ir apzīmētas ar punktiem, ko sauc par fluorforiem, ja tos nav viegli atšķirt.

Daži no lielākajiem mikromasīviem, ko izgatavojuši tādi uzņēmumi kā NimbleGen Systems, satur pat 390,000 XNUMX plankumu. Mikromasīvu bieži izmanto, lai analizētu visu organisma genomu, kurā var būt desmitiem vai vairāk hromosomu, katrai no tām ir sava DNS un RNS. Diemžēl ne visi mikromasīvi ir savietojami viens ar otru, un ir acīmredzams standartu trūkums. Notiek standartizācijas pasākumi, taču pagaidām bez īpašiem panākumiem.

Tāpat kā lielākā daļa progresīvāko biotehnoloģiju pētniecības programmu, testi ar mikromasīvu var radīt milzīgu datu apjomu, radot bioinformātikas jomu, kas cenšas to visu saprast. Var būt atklājumi un korelācijas, kuras mēs jau esam izmērījuši, bet vienkārši neesam pamanījuši datu pārpildes dēļ. Datu ieguve tiek plaši izmantota, lai analizētu šo sarežģīto eksperimentu rezultātus.