Kas ir DNS mikromasīvs?

DNS mikromasīvu tehnoloģija tiek izmantota ģenētiskajos un medicīniskajos pētījumos, lai ļautu zinātniekiem vienlaikus pētīt vairāku tūkstošu gēnu darbību, kā arī to savstarpējās attiecības. Agrāk zinātnieki varēja analizēt tikai dažus gēnus vienlaikus. Ieviešot DNS microarrary tehnoloģiju, vienlaikus var uzraudzīt tūkstošiem gēnu darbību. Daži no veselības stāvokļiem, ko zinātnieki izmanto šo tehnoloģiju, lai pētītu gēnu aktivitāti, ir sirds slimības, vēzis un aptaukošanās. Tas arī ļauj zinātniekiem klasificēt vēzi, pamatojoties uz to izcelsmes vietu un gēnu aktivitātes modeli audzēja šūnā.

DNS mikromasīvs sastāv no zīmoga izmēra priekšmetstikliņa, kas satur molekulas, kas pazīstamas kā DNS, organisma vai vienas tā daļas ģenētiskais kods. DNS tiek novietota uz priekšmetstikliņa noteiktā secībā un regulāri izvietotu horizontālu un vertikālu līniju veidā, izmantojot robotizētu mašīnu. Specifiskā DNS secība un atstatums ļauj zinātniekiem uzzināt izmantotā(-o) gēna(-u) secību.

Pirms zinātnieks var izmērīt gēna aktivitāti uz priekšmetstikliņa, ir jāsavāc audu paraugs no pacienta, parasti asinis. Audu paraugu ievieto šķīdumā un ļauj savākt mRNS — produktu no izteikta gēna, kas transportē informāciju no kodola uz citām šūnas daļām, lai iegūtu proteīnus. MRNS papildina DNS virkni, no kuras tā tika kopēta.

Kad mRNS ir savākta, zinātnieks saistīs fluorescējošu krāsvielu ar mRNS, un to uzliks uz priekšmetstikliņa ar robotizētu mašīnu. MRNS, kas ir komplimentāra DNS, saistīsies ar tās komplementu. Tā kā uz priekšmetstikliņa novietotās DNS secība ir zināma, mRNS, kas saistās ar DNS, norāda specifisko DNS sekvenci, kas tiek ekspresēta šūnā.

Lai skatītu gēnus, skeneris mērīs DNS mikromasīva fluorescējošās zonas. Fluorescējošās krāsas spilgtums parāda gēna aktivitāti, un fluorescējošās krāsas trūkums norāda, ka gēns nav aktīvs. Tāpēc, jo spilgtāka ir fluorescējošā krāsa, jo aktīvāks ir gēns. Jo gaišāka ir fluorescējošā krāsa, jo mazāk aktīvs ir gēns.

Zinot gēna aktivitāti, var noteikt, vai pārmērīgi izteikts gēns var izraisīt konkrētu slimību. Klīniskā vidē, ja jau ir konstatēts, ka gēna pārmērīga ekspresija izraisa konkrētu slimību, no pacienta var paņemt audu paraugu un zinātnieks var izmantot DNS mikromasīva tehnoloģiju, lai izmērītu mērķa gēna ekspresiju, lai palīdzētu noteikt. ja konkrēts gēns varētu būt pacienta slimības cēlonis. DNS mikromasīvs ir spēcīgs veids, kā noteikt, kuri gēni ir iesaistīti konkrētas slimības izraisīšanā.