Kas ir retrotransposons?

DNS segmenta kustības metode ir tā, kā transpozoni tiek klasificēti katrā kategorijā. II klases transpozons ir DNS gabals, kas pārvietojas no vienas vietas uz otru. I klases transposona jeb retrotransposona kustība ir daudz sarežģītāka un ietver divus posmus DNS segmenta kustībai.

Pirmais solis retrotransposona kustībai ir izveidot RNS segmentu, izmantojot DNS gabala transkripciju. RNS tagad var brīvi pārvietoties visā genomā, jo tā nav saistīta ar DNS virkni. Kad RNS sasniedz jauno atrašanās vietu, īpašs enzīms, ko sauc par reverso transkriptāzi, izveido jaunu DNS virkni, pamatojoties uz RNS segmentu. Pēc tam šis jaunais DNS gabals tiek pievienots jaunajai vietai genomā.

Kad retrotransposons tiek pārrakstīts atpakaļ DNS segmentā no RNS kopijas, tam parasti ir gari terminālie atkārtojumi (LTR) DNS sekvences beigās. LTR sastāv no atkārtotām bāzu sekvencēm, kas var būt simtiem vai pat tūkstošiem bāzu garas. Tie parasti ieskauj funkcionālu DNS daļu, piemēram, gēnu, un ir nepieciešami DNS segmenta pievienošanai sākotnējai DNS virknei. LTR ir viens no veidiem, kā zinātnieki var atpazīt, ka DNS sadaļa satur retrotransposonu. Tiek uzskatīts, ka aptuveni 42% no visa cilvēka genoma veido retrotranspozoni.

Sakarā ar to, ka jaunas DNS kopijas tiek izgatavotas, izmantojot RNS reverso transkripciju, retrotransposona pievienošana ir veids, kā palielināt vienā šūnā atrodamās DNS daudzumu. Ja retrotransposons tiek ievietots gēnā vai gēna tuvumā, tas var izraisīt mutāciju. Mutācijas būtībā ir izmaiņas DNS secībā, un tām var būt pozitīva, negatīva ietekme uz genomu vai tās nav, atkarībā no tā, kā tiek mainīta DNS secība.