Ūdens pūķa uzturā parasti jāiekļauj aptuveni desmit procenti ar kalciju un fosforu bagātu dārzeņu un augļu, kā arī daži kukaiņi un barojošie dzīvnieki, tostarp peļu mazuļi, putnu mazuļi vai zivis. Lielākajai daļai ūdens pūķu barība būs jāiekļauj ar minerālvielu piedevas pulveri vismaz reizi nedēļā, ja vien viņi neēd ar pilnu laupījumu bagātu diētu. Kukaiņiem ūdens pūķa uzturā parasti vajadzētu būt mazākai daļai, jo kukaiņu pārmērīga barošana ūdens pūķiem var izraisīt bīstamu zarnu nosprostojumu. Papildus pareizam, sabalansētam uzturam lielākā daļa ūdens pūķu ir jāpakļauj UVA/UVB gaismai apmēram 12 stundas katru dienu. Tas ļauj viņu ķermenim asimilēt un izmantot kalciju, ko viņi ēd.
Rāpuļiem, piemēram, ūdens pūķim, uzturā parasti ir nepieciešams daudz kalcija, olbaltumvielu un fosfora. Tāpēc herpetologi parasti iesaka barot šos dzīvniekus ar smagu barību. Peļu mazuļi, žurku mazuļi, mazi putnu mazuļi un mazas zivis tiek uzskatīti par labiem veseliem laupījuma veidiem šiem dzīvniekiem. Jauni grauzēji, kas ir tikko veci, lai būtu izaudzējuši nedaudz kažokādas, tiek uzskatīti par labāko olbaltumvielu un citu minerālvielu avotu ūdens pūķiem. Šādiem dzīvniekiem parasti vajadzētu būt no 20 līdz 40 procentiem no ūdens pūķa uztura.
Lielākā daļa ekspertu iesaka barot ūdens pūķus tikai beigtus grauzējus. Dzīvi grauzēji var uzbrukt ūdens pūķim vai cīnīties pret to. Tas var izraisīt rāpuļu ievainojumus, infekciju un pat nāvi.
Daži dārzeņu un augļu veidi var būt veselīgs papildinājums ūdens pūķa diētai. Zemenes, vīģes, kantalopes un avenes ir tādu augļu piemēri, kas var piedāvāt ūdens pūķim daudz vitamīnu un minerālvielu, kas tam nepieciešami labai veselībai. Skvošs, pastinaks, zaļās pupiņas un pienenes zaļumi parasti ir arī uztura ziņā piemēroti. Tomēr ne visi ūdens pūķi ēdīs šos ēdienus. Ūdens pūķus, kuri neēd dārzeņus vai augļus, tā vietā var barot ar papildu desmit procentiem dzīvnieku.
Sliekas parasti tiek uzskatītas par noderīgu ūdens pūķa uztura sastāvdaļu, jo tās satur lielu daudzumu olbaltumvielu, fosfora un kalcija, kas parasti ir nepieciešami ūdens pūķiem. Daži eksperti norāda, ka sliekas vien var veidot pat 20 procentus no ūdens pūķa uztura. Cita veida kukaiņi, parasti miltu tārpi un crickets, var veidot 40 līdz 50 procentus no ķirzakas uztura. Minerālvielu piedevas rāpuļiem parasti ir jāapkaisa ar kukaiņiem vismaz reizi nedēļā, lai nodrošinātu, ka ūdens pūķi savā uzturā saņem pietiekami daudz kalcija un fosfora. Bez pietiekamas minerālvielu uzņemšanas šīs radības var nopietni saslimt.