Ideālas inkubatora projektēšanā ir nepieciešami vairāki raksturlielumi, lai nodrošinātu, ka iekārta ir droša, tīra un viegli lietojama. Labi izstrādāts inkubators būs produktīvāks, ar mazāku zaudējumu risku un lielāku potenciālu iegūt papildu krājumus, paplašinoties inkubatora darbībai. Tai arī jāatbilst spēkā esošajiem likumiem, kas attiecas uz inkubatoriem un lopkopību.
Inkubatori tiek izmantoti, lai inkubētu mājputnu un zivju olas, lai izperētu dzīvus mazuļus, un pēc tam audzētu mazuļus, līdz tie ir pietiekami veci, lai tos pārdotu vai transportētu uz citu vietu. Rūpnieciskie inkubatori darbojas nepārtraukti, radot nopietnas dizaina problēmas, jo tajās ir jāizvieto olas un mazuļi dažādās attīstības stadijās. Projektēšanas apsvērumi atšķiras atkarībā no tā, vai iekārta tiek izmantota mājputnu vai zivju audzēšanai.
Abos gadījumos ideālai inkubatoram ir lieliska ventilācija un dizains, kas atvieglo tīrīšanu, lai telpa būtu pēc iespējas higiēniskāka. Tajā jāiekļauj atsevišķas zonas olu inkubēšanai un mazuļu izmitināšanai, lai samazinātu slimības izplatību, kā arī droša zona barības uzglabāšanai un pietiekama saldūdens piegāde. Ideālā inkubatorā ir arī skaidri protokoli darbiniekiem, piemēram, aizliegums pārvietoties starp inkubatoru un perēšanas zonām, lai šīs zonas būtu pēc iespējas nošķirtas.
Teritorijā, kur olas tiek inkubētas un perētas, ir jābūt pietiekami daudz vietas, lai pārvietotos, kā arī vietai, kur izolēt dažādas sugas vai šķirnes. Mājputnu inkubatorā dažādas šķirnes var inkubēt atsevišķos inkubatoros un paplātēs, savukārt zivju inkubatorā sugu nošķiršanai tiks izmantoti dažādi dīķi. Telpai jābūt arī viegli pārskatāmai, lai darbinieki varētu būt uzmanīgiem, ja rodas problēmas, piemēram, temperatūras svārstības vai piemaisījumi ūdenī.
Perēšanas vietās, kur mazuļus izņem pēc izšķilšanās, tīrība ir ļoti svarīga. Liels jaunu dzīvnieku daudzums var radīt satriecošu daudzumu atkritumu, un šie atkritumi ir jāsavāc un jāiznīcina atbildīgi. Ir arī jāievieš pasākumi dzīvnieku barošanai un izolēšanai, lai apstiprinātu, ka tie ir veseli, pirms ļauj tiem sajaukties ar vispārējo populāciju. Apstrādes zona dzīvnieku sagatavošanai nosūtīšanai ir arī svarīga ideālas inkubatora dizaina sastāvdaļa.
Acīmredzot ideālas inkubatora atslēga ir vieta dzīvniekiem, taču ir vajadzīga arī vieta cilvēkiem. Inkubatoriem ir jāveic plaša uzskaite par dzīvniekiem, ko tās audzē, un tam ir nepieciešams daudz biroja telpu. Daudziem ir arī jāsniedz daži veterinārie pakalpojumi, tostarp pamatpakalpojumi, piemēram, jaunu dzīvnieku mērīšana un svēršana, un darbiniekiem ir nepieciešama arī vieta, kur pārģērbties, un dažās inkubatoros ir arī pārtraukuma telpas un dušas zonas.