Nevienam nekad nav atņemta Nobela prēmija, jo organizācija, kas pārvalda Nobela prēmijas, patiesībā to ir īpaši aizliedzusi. Saskaņā ar Nobela fondu “nedrīkst iesniegt apelācijas pret balvu piešķiršanas iestādes lēmumu attiecībā uz balvas piešķiršanu”, un nevienu balvu nevar atsaukt pēc fakta, lai cik pretrunīgi tās šķistu. Neskatoties uz vairākām petīcijām, kurās tiek mudināts atsaukt pretrunīgi vērtētās Nobela prēmijas, ir maz ticams, ka organizācija mainīs savus noteikumus, lai padarītu iespējamu anulēšanu.
Komitejas, kas pārvalda Nobela prēmijas, ir ļoti piesardzīgas. Viņi ļoti rūpīgi pēta kandidātus, bieži piešķirot balvas 20 gadus vai ilgāk pēc Nobela cienīgā sasnieguma. Dažos gadījumos komiteja ir tik ilgi kavējusies pie lēmuma par balvas piešķiršanu, ka apbalvotais ir miris pirms balvas piešķiršanas, un tas izskaidro, kāpēc daži šķietami Nobela cienīgi cilvēki nav saņēmuši Nobela prēmijas.
Dažas Nobela prēmijas noteikti ir bijušas pretrunīgas, īpaši pēc fakta. Piemēram, Antonio Egas Monizs 1949. gadā ieguva Nobela prēmiju medicīnā par tā sauktās “ledus pīķa lobotomijas” izstrādi — brutālu medicīnisku procedūru, kas ir plaši nosodīta. Daži pretrunīgi vērtētie līderi, piemēram, Henrijs Kisindžers un Jasirs Arafats, ir ieguvuši strīdīgās Miera prēmijas, kā arī cilvēki, kuri vēlāk tika uzskatīti par morāli aizdomīgiem, piemēram, vācu autors Ginters Grass, kurš vēlāk atzina, ka dienējis SS Otrā pasaules kara laikā.
Nobela fonds brīvi atzīst, ka dažu balvu piešķiršana ir izraisījusi pretrunas un bažas no starptautiskās sabiedrības. Attiecīgi organizācija ir piekritusi publiskot ierakstus, kas attiecas uz viņu lēmumiem, taču šie ieraksti tiek publiskoti tikai 50 gadus pēc fakta. Arguments ir tāds, ka šīs balvas ir izstrādātas tā, lai tās būtu mūžīgas, nevis tās ietekmētu sociālie jautājumi konkrētajā laikmetā, un tāpēc perspektīvai var būt nepieciešams zināms laiks.
Kā tika apspriests iepriekš Antonio Egas Moniz gadījumā, Nobela prēmijas komiteju spriedums ne vienmēr ir ideāls, un, raugoties vēlāk, dažas Nobela prēmijas, iespējams, nevajadzēja piešķirt. Turpretim ir dažas balvas, kas tolaik bija pretrunīgas, piemēram, Einšteina 1921. gada Nobela prēmija, par kuru tika spriests, un kas vēlāk izrādījās pilnībā nopelnīta. Pretrunīgi vērtēto lēmumu aizstāvji ir arī iebilduši, ka pētnieki ne vienmēr kontrolē to, ko citi cilvēki dara ar viņu izgudrojumiem un atklājumiem, un ka kāds, kurš ir izdarījis apšaubāmas darbības, joprojām spēj dot ieguldījumu kultūras un zinātnes attīstībā.
Lai gan neviena Nobela prēmija nav atsaukta, ir daži gadījumi, kad prēmija ir atteikta. Nacistiskajā Vācijā vairāki apbalvotie bija spiesti atteikties pieņemt balvas Ādolfa Hitlera pavēles dēļ; Hitlers bija aizkaitināts, ka viņš nesaņēma Nobela prēmiju, un nolēma, ka, ja viņš to nevarēs saņemt, neviens vācietis to nedrīkstēs saņemt. Vairāki cilvēki, tostarp Žans Pols Sartrs, arī ir atteikušies no Nobela prēmijas personisku iemeslu dēļ.