Tiek uzskatīts, ka dažas plastmasas pudeles ir potenciāli bīstamas cilvēku veselībai, jo tās satur ķīmiskas vielas, kas var izraisīt veselības problēmas. Parasti tiek uzskatīts, ka cietā plastmasa ar numuru 2, 4 vai 5 ir droša, savukārt plastmasas, kas marķētas ar 1, 3 un 7, ir potenciāli bīstamas, īpaši, ja tās tiek izmantotas atkārtoti. Ņemot vērā bažas par plastmasas pudeļu drošību, daži patērētāji saviem dzērieniem izvēlas izmantot metāla vai stikla pudeles.
Bažas rada vairākas ķīmiskas vielas, ko izmanto noteiktu plastmasu ražošanā. Pirmais ir bisfenols-A (BPA), kas, kā zināms, ir endokrīnās sistēmas traucētājs, kas nozīmē, ka tas izraisa hormonu nelīdzsvarotību. BPA ir saistīts ar vēzi laboratorijas dzīvniekiem, un pastāv zināmas bažas, ka tas var izraisīt vēzi arī cilvēkiem. BPA visvairāk ir sastopams Lexan, cietā plastmasā, kuras numurs ir 7; Lexan pudeles bieži tika pārdotas kā videi draudzīgas ilgstošas lietošanas ūdens pudeles, pirms tika pilnībā realizēti BPA riski.
Vēl viena ķīmiska viela, kas rada bažas plastmasas pudelēs, ir bis(2-etilheksil)ftalāts (DEHP), ķīmiska viela, ko izmanto kā plastifikatoru. DEHP atrodas elastīgās plastmasās ar tādiem cipariem kā 1 un 3; šīs plastmasas bieži ir paredzētas vienreizējai lietošanai un nav paredzētas ilgstošai atkārtotai lietošanai. Tiek uzskatīts, ka DEHP arī var izraisīt endokrīnās sistēmas traucējumus, un dažos pētījumos tas ir saistīts ar aptaukošanos. Citas plastmasas ražošanā izmantotās ķīmiskās vielas var ietvert tādas lietas kā hlors, kas parasti nav labvēlīga cilvēka veselībai.
Ķīmiskās vielas, kas atrodas plastmasas pudelēs, var iekļūt to saturā vairākos veidos. Ilgstoša regulāra lietošana var izraisīt izskalošanos, un izskalošanos var paātrināt pudeles bojājumi, karstuma iedarbība un tīrīšanas līdzekļi. Tā kā ķimikālijas iekļūst pudeles saturā, tās apdraud ikvienu, kas dzer no pudeles, kas var netīši norīt šīs ķīmiskās vielas. Cilvēkiem, kuri lieto daudz plastmasas pudeļu, ilgstoša iedarbība, izskalojoties, nākotnē var izraisīt veselības problēmas.
Plastmasas, kas marķētas ar “1”, ir paredzētas vienreizējai lietošanai un pēc tam pārstrādei. Parasti tiek uzskatīts, ka šādas plastmasas ir drošas vienreizējai lietošanai, un tas izskaidro, kāpēc to plaši izmanto bezalkoholisko dzērienu iepakošanai, taču daži cilvēki uzskata, ka tos nevajadzētu izmantot atkārtoti. Šo plastmasas pudeļu atkārtota izmantošana var pakļaut patērētājus izskalošanās un DEHP iedarbības riskam.