Visbiežāk ziņotās astaksantīna blakusparādības ir nekaitīgas pigmenta izmaiņas, piemēram, viegli oranža nokrāsa uz ādas vai izkārnījumiem. Pat pie lielām devām nav novērota toksiska ietekme ne uz dzīvniekiem, ne uz cilvēkiem. Citām retāk sastopamajām astaksantīna blakusparādībām ir lielāka ietekme, un tādas blakusparādības kā zems asinsspiediens un hormonu līmeņa izmaiņas var nopietni ietekmēt veselību.
Astaksantīnu visbiežāk izmanto kā piedevu dzīvnieku barībai, un tas pievieno pigmentu krabjiem, garnelēm, omāriem un lašiem, piešķirot tiem pazīstamo sarkanīgi oranžo krāsu. Saskaņā ar Amerikas Savienoto Valstu federālo noteikumu kodeksu astaksantīns kā dzīvnieku barības piedeva parasti ir atzīts par drošu, un lielākā daļa cilvēku bez jebkādas reakcijas var lietot ar astaksantīnu barotas jūras veltes. 1999. gadā ASV Pārtikas un zāļu pārvalde atļāva astaksantīnu kā pārtikas sastāvdaļu lietošanai pārtikā.
Kā uztura bagātinātāju astaksantīnu visbiežāk izmanto kā antioksidantu holesterīna samazināšanai. Advokāti arī iesaka astaksantīnu, lai uzlabotu acu veselību un ārstētu karpālā kanāla sindromu, artrītu, muskuļu traumas, kuņģa-zarnu trakta problēmas un vīriešu neauglību. Tomēr jāatzīmē, ka nav pietiekami daudz pierādījumu, lai atbalstītu kādu no šīm prasībām, un nav pierādīts, ka šis papildinājums labvēlīgi ietekmē veselību.
Biežas astaksantīna blakusparādības ir palielināta pigmentācija, matu augšana, hormonu līmeņa izmaiņas un zems asinsspiediens. Ir novērots arī pazemināts kalcija līmenis, samazināts libido un krūšu palielināšanās vīriešiem, taču šīs astaksantīna blakusparādības ir retākas. Ir iespējamas arī alerģiskas reakcijas, kas var būt diezgan bīstamas. Ikvienam, kam ir zināma alerģija pret šo vielu, vajadzētu izvairīties no astaksantīna un ar astaksantīnu barotiem pārtikas produktiem.
Vēl viena nopietna problēma ir zāļu mijiedarbība. Piemēram, astaksantīns var pastiprināt asinsspiediena medikamentus, un tas var izraisīt asinsspiediena pazemināšanos bīstami zemā līmenī. Hormonu ārstēšanu un dzimstības kontroli var ietekmēt piedevas ietekme uz hormonu līmeni. Līdzīgas savstarpējas reakcijas ir novērotas ar dažiem antihistamīna līdzekļiem, un astmas zāles var slikti reaģēt uz astaksantīnu. Var tikt ietekmēti arī aknu enzīmi, kas ir atbildīgi par dažādu zāļu izvadīšanu no asinīm, kā rezultātā palielinās šo zāļu līmenis, kas paliek apritē.
Reakcijas ir iespējamas arī ar citiem uztura bagātinātājiem un augu izcelsmes līdzekļiem. Saw palmetto, melnā cohosh vai citas zāles, kas ietekmē hormonus, var reaģēt neparedzami. Astaksantīna blakusparādības, piemēram, zems asinsspiediens un pazemināts kalcija līmenis, var pastiprināt vielas ar līdzīgu iedarbību. Citu karotinoīdu antioksidantu, piemēram, beta karotīna un likopēna, lietošana kopā ar astaksantīnu samazina uzsūkšanos un nav ieteicama.