Labākā mielodisplastiskā sindroma ārstēšana bieži atšķiras atkarībā no vairākiem dažādiem faktoriem, kas ietekmē pacienta vajadzības. Jaunākiem pacientiem ar labu veselību var būt piemērota agresīvāka ārstēšana, lai palēninātu vai apturētu slimību. Citiem var būt tikai atbalstoša aprūpe, piemēram, transfūzijas vai antibiotikas, kas ārstē sindroma sekas un uzlabo viņu dzīves kvalitāti. Tiem, kuriem ir mazāk smagas slimības formas, var būt nepieciešamas arī atbalstošas aprūpes iespējas.
Viena mielodisplastiskā sindroma ārstēšanas iespēja, kas dažiem cilvēkiem var dot ļoti labus rezultātus, ir ķīmijterapija, kam seko kaulu smadzeņu transplantācija. Ķīmijterapiju izmanto, lai iznīcinātu nepareizi funkcionējošās kaulu smadzeņu šūnas, un pēc tam to aizvietošanai izmanto atbilstoša donora šūnas. Dažiem pacientiem šī metode ir spējusi izārstēt slimību; vairums gadījumu ir neārstējami. Citiem tas spēj ievērojami palēnināt tā progresēšanu. Tomēr procedūra ir sarežģīta un riskanta, tāpēc to bieži izmanto tikai jauniem un spēcīgiem pacientiem vai tiem, kuriem ir ļoti agresīvi mielodisplastiskā sindroma veidi.
Pacienti, kuriem ķīmijterapija un transplantācija nav piemērota, parasti saņem atbalstošu aprūpi, lai palīdzētu mazināt slimības negatīvās sekas. Viens svarīgs atbalstoša mielodisplastiskā sindroma ārstēšanas veids ir asins pārliešana. Slimība iznīcina asins šūnas un ietekmē ķermeņa spēju radīt vairāk, tāpēc anēmija bieži vien ir problēma šiem pacientiem. Pārliešana var palīdzēt aizstāt zaudētās asinis un cīnīties ar anēmijas sekām.
Augšanas faktoru izmantošana ir vēl viena mielodisplastiskā sindroma ārstēšana anēmijas ārstēšanai. Augšanas faktori ir vielas, kas stimulē sarkano asins šūnu veidošanos. Augšanas faktora veidu, ko parasti izmanto ar šo slimību, sauc par eritropoetīnu.
Vairākas zāles arī tiek uzskatītas par noderīgām mielodisplastiskā sindroma ārstēšanā noteiktos gadījumos. Tādas zāles kā lenalidomīds un antitimocītu globulīns var palīdzēt cīnīties ar anēmiju un samazināt nepieciešamību pēc asins pārliešanas pacientiem ar specifiskām slimības formām. Pacientiem, kuriem tiek veikta asins pārliešana, var būt nepieciešams deferoksamīns, lai palīdzētu cīnīties pret dzelzs uzkrāšanos asinīs un audos. Dažiem pacientiem var būt nosliece uz leikēmijas attīstību; var lietot tādas zāles kā azacitidīns un decitabīns, lai palīdzētu to aizkavēt vai apturēt. Cilvēki ar mielodisplastisko sindromu var būt uzņēmīgi pret infekciju, un viņiem var būt nepieciešama arī ārstēšana ar antibiotikām.