Galvenā atšķirība starp ateistu un agnostiķi ir tā, ka ateists netic, ka Dievs vai dievi pastāv, turpretim agnostiķis nav pārliecināts abos gadījumos, jo viņi saka, ka Dieva vai dievu esamību nevar pierādīt. Ateists var būt vājš ateists vai spēcīgs ateists. Vājš ateists var teikt: “Es neesmu pārliecināts, vai dievi pastāv, tāpēc es nevienu nepielūdzu. Spēcīgais ateists komentē: “Nav Dieva vai dievu.”
Daži cilvēki terminus ateists vai agnostiķis lieto aizvietojami. Cik liela atšķirība patiesībā ir starp vāju ateistu un agnostiķi? Patiesībā ir zināma atšķirība. Ateists neatkarīgi no tā, vai tas ir vājš vai stiprs, viņš nemeklē garīgu nozīmi, meklējot pierādījumus par dievu. No otras puses, agnostiķis var meklēt pierādījumus vai būt atvērts pierādījumiem vai ticībai, ko cilvēki izmanto, lai definētu Dievu. Agnostiķis ne vienmēr izslēdz, ka ticība viņam vai viņai varētu rasties kādā nākotnē.
No otras puses, ateists pilnībā noraida uzskatu par pievēršanos ticībai Dievam. Pat ja ateists ir vājš, viņš vai viņa neizvēlas pielūgt kādu dievu. Tas nenozīmē, ka visi ateisti paliks ateisti uz mūžu, bet daudzi tā dara.
Viens no galvenajiem ateisma argumentiem ir tas, ka Dievs nekādi nevar pastāvēt. Kā visvarenā būtne varēja pieļaut uz zemes notiekošo ļaunumu, piemēram, genocīdu? Kāpēc visvarena būtne ignorētu daudzos ticīgo palīdzības saucienus?
Lielākā daļa cilvēku, kas tic Dievam, apgalvo, ka lūgšana nenozīmē, ka tiek garantēta atbilde uz savām lūgšanām. Turklāt Dieva ceļi ir noslēpumaini un pārsniedz cilvēku izpratni, tāpēc mēs nevaram pilnībā saprast, kāpēc Dievs pieņemtu laissez-faire politiku pasaulē.
Agnostiķis var uzdot tos pašus jautājumus, ko ateists, bet reizēm var novērtēt noslēpumainos veidus, kā dievs vai dievi varētu pārvietoties. Agnostiķim var būt arī nosacīta pārliecība par saprātīgu klātbūtni, taču viņi uzskata, ka reliģijas ir iekļāvušās doktrīnā un nav spējušas skaidri definēt šādu klātbūtni. Agnostiķa paziņojums atkal varētu būt šāds: “Dažreiz es domāju, ka tur var būt kaut kas, bet es neesmu pārliecināts, kas tas ir.”
Tādējādi galvenās atšķirības starp ateistu un agnostiķi ir saistītas ar atvērtību jautājumam par to, vai Dievs pastāv. Agnostiķis meklē pierādījumus vai pārveidojošu ticības pieredzi. No otras puses, ateists atsakās godināt nevienu dievu, jo uzskata, ka dievs neeksistē.