Kas ir TATA kaste?

Dzīvos organismos dezoksiribonukleīnskābes (DNS) transkripcija ir sākotnējais solis, kas nepieciešams gēna ekspresijai. TATA kaste, kas pazīstama arī kā Goldberg-Hogness kaste, ir DNS reģions, kas palīdz uzsākt transkripcijas procesu. Tā ir daļa no promotora reģiona, kas regulē gēnu ekspresiju, nodrošinot saistīšanās vietu fermentiem, kas iesaistīti gēnu transkripcijā. TATA kaste ir atrodama eikariotos – organismos, kuru šūnās ir sarežģītas ar membrānu saistītas struktūras, tostarp cilvēkiem.

DNS sastāv no nukleotīdiem, atkārtotām strukturālām vienībām, kurām ir četras šķirnes: adenīna (A), timīna (T), guanīna (G) un citozīna (C) nukleobāzes. Tā kā šīs bāzes atkārtojas, tās veido modeļus, kas kodē ģenētisko informāciju. Tie arī veido pārus, ķīmiski savienojoties komplementāri, adenīnam pievienojoties timīnam un guanīnam pievienojoties citozīnam. Bāzu pāri savieno abas DNS molekulas virknes dubultās spirāles struktūrā.

Kad DNS tiek transkribēta, fermenti sadala dubulto spirāli to veidojošos pavedienos, atklājot ģenētisko kodu dublēšanai. Katra DNS virkne tiek izmantota kā veidne ribonukleīnskābes (RNS) virknes sintezēšanai. Enzīms, kas pazīstams kā RNS polimerāze, konstruē RNS ķēdi, saistot komplementāras nukleobāzes ar katru eksponēto DNS virkni.

Lai pilni gēni tiktu transkribēti ziņojuma RNS (mRNS) iespējamai ekspresijai, RNS polimerāzei jāsāk transkripcija pareizajā DNS sekvences punktā. Šo punktu, kas pazīstams kā iniciācijas vieta, norāda promotora reģions, kas atrodas nedaudz augšpus gēna. TATA kaste ir DNS secība, kas sastāv no nukleobāzēm TATAAA, kas atrodas promotora reģionā apmēram 25 bāzu pārus pirms transkripcijas vietas.

Olbaltumvielas, kas pazīstamas kā transkripcijas faktori, saistās ar TATA kastīti. Viens no tiem, TATA saistošais proteīns (TBP), ir specifisks TATA, savukārt citi var saistīties ar ne-TATA promotora reģioniem. RNS polimerāze spēj atpazīt transkripcijas faktoru klātbūtni kā signālu, lai saistīties ar šo vietu. Pēc saistīšanās ar TATA kastīti RNS polimerāze atrodas iniciācijas vietā un tagad var sākt transkribēt gēnu.

Lielākā daļa gēnu promotora reģionu nesatur TATA kastīti. Gēnās, kurās nav TATA, transkripcijas faktori atpazīst citas promotora sekvences, un RNS polimerāze saistās ar tām. Pētnieki ir atklājuši regulējuma atšķirības starp gēniem ar TATA kastīti un tiem, kuriem nav TATA kastes, pētot paraugorganismus, piemēram, Saccharomyces raugu un augļu mušu Drosophila.