Peptīdi ir lielas polipeptīdu ķēdes, kas sastāv no līdz 50 aminoskābēm, kuras var klasificēt pēc funkcijas un arī pēc sintēzes. Daži izplatīti peptīdu veidi, kas klasificēti pēc funkcijas, ir hormoni, neiropeptīdi un alkaloīdi. Ja peptīdus klasificē pēc sintēzes, tie var būt ribosomāli, neribosomāli un peptoniski. Peptīdu klasifikācijas sistēma tiek uzskatīta par nepilnīgu zinātni, jo viens peptīds var vienlaikus piederēt vairākām grupām, un zinātnieki turpina diskutēt par to, kad peptīds jāklasificē kā proteīns vai proteīns kā peptīds. Daudzi zinātnieki ir vienisprātis, ka peptīds nevar viegli pielāgoties noteiktam modelim, savukārt proteīns pēc būtības vairāk atšķiras no konformācijas.
Hormoni, viena no visizplatītākajām peptīdu klasifikācijām cilvēka organismā, ir specifiskas kurjermolekulas, ko izmanto šūnu saziņā. Hormoni tiek identificēti kā tādi, jo tos izdala un sintezē specializētas šūnu grupas, ko sauc par endokrīnajiem dziedzeriem. Pēc sekrēcijas hormonu peptīdi ceļo uz mērķa orgāniem, kur tie darbojas. Hormona forma ir īpaši saistīta ar receptoriem uz attiecīgā mērķa orgāna šūnu membrānām. Piemēram, hormonu peptīdiem glikagonam un insulīnam ir specifiskas receptoru vietas aknās, kas palīdz tiem kontrolēt cukura līmeni asinīs.
Neiropeptīdi ir plaši izplatīti ķermeņa centrālajā un perifērajā nervu sistēmā, un tiem ir specifiskas inhibējošas un ierosmes funkcijas. Neiropeptīdi darbojas gandrīz tāpat kā neirotransmiteri, piemēram, serotonīns un dopamīns. Viena no vispazīstamākajām neiropeptīdu klasēm ir endorfīni. Endorfīnus uzskata par ķermeņa endogēniem pretsāpju līdzekļiem, ko bieži salīdzina ar narkotiku morfīnu.
Daļa no endorfīnu funkcijas ietver cita neiropeptīda, vielas P, inhibēšanu, kas pārraida sāpju signālus no perifērās nervu sistēmas uz centrālās nervu sistēmas uztvērējiem. Dažreiz neiropeptīdi var darboties kā hormoni arī noteiktās ķermeņa sistēmās.
Attiecībā uz peptīdu klasifikāciju to sintēzes dēļ lielākā daļa ir ribosomu tipa; šis peptīdu tips tiek sintezēts, kad šūnā tiek translēta ribonukleīnskābe (mRNS). Tulkošanas laikā notiek ķīmisks process, kurā viena aminoskābes karboksilgrupa savienojas ar citu aminoskābi, lai izveidotu aminoskābju ķēdes sākumu. Ribosomu peptīdi bieži sastāv no 30 līdz 40 aminoskābēm, kas savienotas kopā. Neribosomu tipa peptīds tiek sintezēts, ja ir fermentatīvie katalizatori. Peptoniskie peptīdi ir reti sastopami un veidojas gremošanas procesos organismā.