Kas ir sintētiskais peptīds?

Dipeptīds satur divas aminoskābes un vienu peptīdu saiti, savukārt tripeptīds satur trīs aminoskābes un divas peptīdu saites. Vienošanās ir tāda, ka aminoskābju ķēdes līdz 50 aminoskābēm ir pazīstamas kā peptīdi, bet garākas par olbaltumvielām. Galvenā atšķirība sintētiskā peptīda ražošanā ir tā, ka aminoskābes tiek pievienotas no karboksilāta grupām uz priekšu. Šūnās ribosomas sāk sintezēt peptīdus ar aminogrupu.

Visizplatītākā sintētisko peptīdu iegūšanas metode ir cietās fāzes peptīdu sintēzes izmantošana. Tas ļauj veidot sintētisku peptīdu, kas dabā nebūtu sastopams, piemēram, tādus, kas satur nedabiskas aminoskābes. Ar šo metodi peptīdu ķēdes tiek imobilizētas uz porainām lodītēm. Aminoskābes tiek apstrādātas ar aizsarggrupām Fmoc vai Boc, lai pasargātu tās no nevēlamām reakcijām.

Peptīdi tiek pakļauti atkārtotiem savienošanas un aizsardzības cikliem. Neaizsargāts peptīds, kas pievienots cietajai fāzei, satur brīvu aminogala grupu, kas ir savienota ar slāpekli aizsargātu aminoskābju vienību. Pēc tam šī vienība tiek noņemta, un tā var tālāk reaģēt, pievienojot citu aminoskābi. Kad peptīds ir pabeigts, to atdala no sveķiem un attīra ar apgrieztās fāzes HPLC. Sintētiskā peptīda izgatavošanas procesu var slēgt ar vairākiem uzņēmumiem.

Peptīdu sintēze tiek veikta dažādiem pētniecības mērķiem. Daži pētnieki vēlas pārbaudīt, vai viņi ir pareizi noteikuši dabā sastopamo peptīdu struktūru. Citi veic bioloģiski aktīvo proteīnu un peptīdu struktūras/funkciju pētījumus. Šādi peptīdi ietver hormonus un vairākus toksīnus. Bieži sintētiskos peptīdus izmanto kā zondes, lai pētītu olbaltumvielu molekulu aktīvās daļas.

Peptīdi ir nozīmīgi masu spektrometrijā, palīdzot noteikt, vai pētnieks ir izolējis konkrētu proteīnu. Katrs proteīns sadalās unikālu peptīdu modelī, ko var noteikt ar masas spektrometriju. Antivielu veidošanas process pret olbaltumvielām dzīvniekiem ir kļuvis daudz vieglāks, parādoties peptīdu sintēzei. Proteīns nav rūpīgi jāattīra un jāizmanto antivielu radīšanai. Var sintezēt peptīdu līdz proteīna fragmentam un pēc tam izmantot šo peptīdu kā antivielu avotu.

Īpaši aktīva sintētisko peptīdu pētījumu joma ietver jaunu terapeitisko metožu, piemēram, jaunu vakcīnu, izstrādi. Peptīdu sintēzi izmanto, lai radītu peptīdu bibliotēkas, lai pārbaudītu to bioloģiskās īpašības. Ir izstrādāti peptīdi, kas iekļūst šūnās, kas var ievadīt šūnās dažādus faktorus, tostarp peptīdus, proteīnus un DNS celtniecības blokus. Šādām metodēm ir liels potenciāls kā zāļu piegādes sistēmām.