Kaulu sistēma ir ķermeņa atbalsts. Tas aizsargā orgānus un nodrošina noenkurojumu saitēm, cīpslām un muskuļiem, kas ļauj kustēties. Lai gan gan vīriešu, gan sieviešu skeleta sistēmās ir vienāds kaulu skaits, starp tām pastāv atšķirības. Atšķirības starp vīriešu un sieviešu skeleta sistēmām ir strukturālas un ietver tādas jomas kā iegurnis, galvaskauss un ekstremitātes. Kaulu masa un attīstība ir divas papildu atšķirības skeleta sistēmās.
Viena no jomām, kas atšķiras starp vīriešu un sieviešu skeleta sistēmu, ir iegurnis. Sievietes iegurņa kauls un iegurņa reģions ir veidots savādāk nekā vīrieša, jo sievietes iegurņa reģions ir izveidots, lai nodrošinātu dzemdību procesu. Sieviešu iegurņa reģioni ir vairāk apļveida, un iegurņa kauls ir mazāks un platāks. Savukārt vīriešu iegurņa dobumi nav tik sekli.
Strukturālās atšķirības starp vīriešu un sieviešu skeleta sistēmu ir acīmredzamas arī galvaskausā. Neliela izvirzīta daļa, kas atrodas galvaskausa aizmugurē, ko sauc par ārējo pakauša izciļņu, ir vairāk redzama vīriešu galvaskausā nekā sievietes galvaskausā. Sievietes galvaskausa žokļa kauli ir arī noapaļotāki, savukārt vīrieša žokļa kauls ir kvadrātiskāks. Sievietes galvaskausa uzacu kauli nav tik izteikti kā vīrieša galvaskausa kauli. Šie aspekti rada atšķirības pazīmes, kas rada vizuālas atšķirības vīriešu un sieviešu sejas struktūrās.
Kauli, kas veido skeleta ekstremitātes, arī parāda atšķirības starp vīriešu un sieviešu skeleta sistēmām. Elkoņa kauls, rādiuss un pleca kauls ir trīs kauli, kas veido rokas, savukārt stilba kauls, stilba kauls un augšstilba kauls ir kāju kauli. Vīriešiem šie kauli parasti ir garāki un biezāki nekā sievietēm. Arī pirkstu kauli, ko sauc par falangām, vīriešiem parasti ir lielāki nekā sievietēm. Tomēr dažiem vīriešiem ir īsāki kauli nekā sievietēm.
Kopējā masa veicina atšķirību starp vīriešu un sieviešu skeleta sistēmām. Vīriešu skeleti bieži ir smagāki un daudz lielāki. Lai gan skeleta masa var būt vispārējs atskaites punkts, to nevar izmantot vienu pašu. Ir daži vīrieši, kuri ir mazāki par vidējo un kuriem būs mazāki skeleti. Turklāt ir dažas sievietes ar lielākiem skeletiem par vidējo. Lai noteiktu, vai skelets ir vīrietis vai sieviete, jāņem vērā arī citas galvenās atšķirības, kā arī ģenētika un etniskā piederība.
Atšķirības starp vīriešu un sieviešu skeleta sistēmu ietekmē arī kaulu attīstība. Hormoniem ir liela nozīme kaulu augšanā. Vīriešiem testosterons ir hormons, kas ietekmē kaulu augšanu un formu, savukārt sieviešu hormonu, kas ietekmē kaulu attīstību, sauc par estrogēnu. Pubertātes laikā estrogēna līmenis ir daudz augstāks sievietēm un testosterona līmenis vīriešiem, izraisot sieviešu kaulu attīstību līdz 18 gadu vecumam un vīriešu augšanas apstāšanos līdz 21 gada vecumam.