Patoloģija ir pētījums par audu, šūnu un orgānu izmaiņām organismā slimības rezultātā. Patogenitāte ir termins, ko lieto patogēnam, kas organismā var izraisīt infekcijas slimības. Šo mikroorganismu izraisītās veselības problēmas ietver gan vienšūņu, gan bakteriālas infekcijas un infekcijas slimības. Organisma patogenitāti bieži sauc par tā virulenci.
Visas sistēmas organismā darbojas kopā, lai uzturētu homeostāzi jeb normālu fizioloģisko apstrādi. Homeostāze ir process, kurā organisms spēj regulēt temperatūru, vielmaiņu un asinsspiedienu, neskatoties uz ārējās vides apstākļiem. Tomēr, ja mainās ķermeņa sistēmas, var rasties slimība. Patologi pēta slimības, lai saprastu, kā tās darbojas, un lai nodrošinātu to ārstēšanu.
Patoģenēze attiecas uz veidu, kādā slimība sākas un pēc tam attīstās laika gaitā. Patologs, pētot patogēnu, īpaši pēta šūnu un fizioloģiskās aktivitātes, kas piedalās slimības attīstībā. Patoģenēzes process ietver slimības cēloņa noteikšanu, tās radītos bojājumus un izmaiņas, kas notikušas kopš tās klātbūtnes. Daži mikroorganismi bieži ir patogēni vai slimību izraisoši, bet citi reti izraisa slimības. Piemēram, oportūnistisko patogēnu patogenitāte cilvēkiem ar labu veselību neatkārtojas, bet var izraisīt infekcijas cilvēkiem ar zemu imūnsistēmu.
Tādas slimības kā infekcijas izraisa mikroorganismi. Šie mikroorganismi ir patogēni un ietver baktērijas un vienšūņus. Ķermeņa bojājumi šādu patogēnu rezultātā var būt tieši no iznīcinātiem audiem vai arī tie var būt netieši tā radītā toksīna rezultātā. Patogenitāti vai virulenci patogēniem, piemēram, baktērijām un vienšūņiem mēra patologi un nosaka pēc organismu skaita, kas nepieciešams, lai slimība notiktu.
Baktērijas ir iesaistītas daudzās cilvēku slimībās. Šādas infekcijas var būt nelielas, piemēram, inficēta acs vai auss. Tās var būt arī potenciāli letālas, piemēram, tuberkuloze, stāvoklis, kas parasti skar plaušas un izraisa tādus simptomus kā svīšana naktī, drudzis un svara zudums. Šāda veida patogēni var iekļūt organismā caur ādu vai atverēm, piemēram, muti un degunu. Slimība rodas, kad infekcijas baktērija ražo endotoksīnus un eksotoksīnus, kas ir indīgi, izraisot audu iekaisumu.
Vēl viens patogēns ir vienšūņi, kas ir primitīvs dzīvnieks, kas sastāv no vienas šūnas. Izmērā tie ir lielāki nekā baktērijas, taču joprojām ir mikroskopiski. Lielākā daļa dzīvo neatkarīgi un spēj izvadīt, absorbēt pārtiku un elpot; tomēr ir daži vienšūņi, kas ir parazīti un izraisa cilvēku slimības. Giardiasis ir vienšūņu izraisīta slimība, kas izraisa zarnu infekciju, izraisot caureju.